蛋白质完整版.pptVIP

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4.3 肽 重要的三肽——谷胱甘肽(GSH) 组成:谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸 维护蛋白质活性中心的巯基 参与二硫化合物相互转化 作为某些酶的辅酶参与氧化 还原反应 g-肽键 4.4 蛋白质的分子结构 蛋白质的结构分为四大层次 一级结构 初级结构(共价结构) 二级结构 高级结构(分子构象) 超二级结构 结构域 三级结构 四级结构 4.4 蛋白质的分子结构 蛋白质的分子结构 4.4 蛋白质的分子结构 蛋白质的一级结构及其测定 蛋白质的分子构象 蛋白质分子结构与功能的关系 4.4 蛋白质的分子结构 蛋白质的一级结构及其测定 指蛋白质分子中氨基酸残基的连接方式和排列顺序。包括肽链的数目、端基的组成、氨基酸的排列和二硫键的位置等,又称化学结构 表示法 三字母表示法 单字母表示法 标注二硫键 蛋白质的一级结构 牛胰岛素 4.4 蛋白质的分子结构 蛋白质一级结构的测定 蛋白质制剂的纯化 活性蛋白质(未变性蛋白质)分子量测定 活性蛋白质肽链数的测定和分离 氨基酸序列测定 氨基酸定量组成测定 肽链末端分析,包括N端和C端 肽链的部分裂解及肽片段的分离 确定各个肽段在多肽链中的次序 确定蛋白质分子中二硫键和酰胺基的位置 4.4 蛋白质的分子结构 氨基酸组成分析 全自动氨基酸分析仪 4.4 蛋白质的分子结构 氨基酸末端分析 N-末端分析 C-末端分析 二硝基氟苯(DNFB)法 二甲基氨基萘磺酰氯法(DNS-Cl法) 异硫氰酸苯酯法(Edman法) 肼解法 羧肽酶法 主要的多肽测序方法 4.4 蛋白质的分子结构 蛋白质中肽链的拆离 非共价连接:温和条件解离 共价连接:较强条件切断 还原法 氧化法 4.4 蛋白质的分子结构 肽链的部分降解和肽片段的分离 化学裂解法:溴化氰法、羟胺法 酶水解法:胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、 胃蛋白酶、嗜热菌蛋白酶 肽段氨基酸序列的测定及肽段的重叠 Edman降解法是用于序列分析最主要的方法 4.4 蛋白质的分子结构 肽链的降解与肽片段的测定排序 4.4 蛋白质的分子结构 推导氨基酸序列 4.4 蛋白质的分子结构 蛋白质的分子构象(空间结构) 由许多酰胺平面组成,平面之间以Ca相隔 多肽主链的基本结构 氨基端 或N端 羧基端 或C端 线性的多肽链在空间中折叠成特定的三维结构,即蛋白质的高级结构或分子构象 这对二面角决定了相邻的两个酰胺平面所有原子在空间上的相对位置,就决定了肽链的构象 4.4 蛋白质的分子结构 二级结构 螺旋结构(a-螺旋) b-折叠 转角(b-转角) 无规则卷曲 多肽主链骨架有规则的盘曲折叠所形成的构象,不涉及侧链基团的空间布,靠肽链中的氢键得到稳定 4.4 蛋白质的分子结构 a-螺旋 螺距=0.54nm 每一圈包含3.6个氨基酸 R基团伸向外侧 相邻螺旋间形成链内氢键(N-H和C=O),取向与螺旋轴几乎平行 氢键 4.4 蛋白质的分子结构 左手螺旋和右手螺旋 右手螺旋较稳定 天然蛋白质中主要 是右手螺旋 4.4 蛋白质的分子结构 肽链几乎完全伸展 呈锯齿状,按层平行排列,肽平面呈片状,称为折叠片 相邻肽链形成氢键,氢键几乎垂直于肽链 肽链的R基团在肽平面的上下交替出现 反平行式的b-折叠 平行式的b-折叠 氢键 4.4 蛋白质的分子结构 出现在肽链180°回折处的特殊结构,由4个氨基酸残基构成 第一个残基的C=O与第四个残基的N-H形成氢键 转角结构通常负责各种二级结构单元之间的连接作用 对于确定肽链的走向起着决定性的作用 b-转角 4.4 蛋白质的分子结构 无规则卷曲 多肽链主链不规则随机盘曲形成的构象 球蛋白分子中,往往含有较多的无规卷曲,它 使蛋白质肽链从整体上形成球状构象 4.4 蛋白质的分子结构 超二级结构 aa( a-螺旋组合) bXb或bab bbb ( b-折叠组合) 指二级结构的基本结构单位相互聚集,形成有规律、空间上能辨认的二级结构的聚集体,充当三级结构的构件 4.4 蛋白质的分子结构 bab环 右手交连的b折叠 反平行b折叠桶 4.4 蛋白质的分子结构 结构域 由相邻二级结构单元联系而成的局部性区域,是多肽链的独立折叠单位,不同的结构域往往具有不同的功能。常见的结构域大小在100-200个残基之间 免疫球蛋白IgG的12个结构域 4.4 蛋白质的分子结构 三级结构 指一条多肽链中所有原子的空间排列,即由一条多肽

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