宏基因组测序简介(发布版).pdfVIP

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宏宏基基因因组组测测序序 概概 要要 宏基因组测序简介 宏基因组学发展 如何完成一次mNGS 难点与挑战 2 宏基因组测序简介 3 ““内内因因++外外需需””双双轮轮驱驱动动NNGGSS需需求求 内因:感染性 疾病的新发和 再发对临床诊 的准确性和 实效性提出更 高要求。 外需:“限抗 令”推动NGS在 该行业发展。 4 为为什什么么进进行行宏宏基基因因组组测测序序?? 用电镜观察病原体,其 很多病原体培养困难。 敏性相对较低。 四四大大 瓶瓶颈颈 PCR法必须基于已知的基 血清学反应,高效的特异 因序列,对于未知序列的 性抗体很难获得,有的出 病原体和变异性大的病原 现交叉反应而影响结果。 体此法难以实施。 5 现现有有病病原原体体检检测测技技术术[[11]] 技术分类 优势 劣势 时间 开展检测的医院 • 通量大; • 低灵敏性和特异性; 抗原抗体[2-3] • 检测急性或以前的感染; 1~3小时 大型三甲 • 对于细菌,相近的抗原易发 交叉反应。 • 低成本 已知特定 • 检测特定感染; 病原微 • 快速; • 成本高于培养的方法; 物验证 PCR[2,4] • 高灵敏度; 1~2小时 大型三甲 (新冠前) • 受扩增偏差影响; • 准确。 • 无法区分活细胞/死细胞。 芯片[10-11] • 中通量 • 结果稳定性、平行性差 4~8小时 几乎未开展 • 准确率、可靠性依赖于技术经验; 通常2~3天

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