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宏宏基基因因组组测测序序
概概 要要
宏基因组测序简介
宏基因组学发展
如何完成一次mNGS
难点与挑战
2
宏基因组测序简介
3
““内内因因++外外需需””双双轮轮驱驱动动NNGGSS需需求求
内因:感染性
疾病的新发和
再发对临床诊
的准确性和
实效性提出更
高要求。
外需:“限抗
令”推动NGS在
该行业发展。
4
为为什什么么进进行行宏宏基基因因组组测测序序??
用电镜观察病原体,其
很多病原体培养困难。
敏性相对较低。
四四大大
瓶瓶颈颈
PCR法必须基于已知的基
血清学反应,高效的特异
因序列,对于未知序列的
性抗体很难获得,有的出
病原体和变异性大的病原
现交叉反应而影响结果。
体此法难以实施。
5
现现有有病病原原体体检检测测技技术术[[11]]
技术分类 优势 劣势 时间 开展检测的医院
• 通量大;
• 低灵敏性和特异性;
抗原抗体[2-3] • 检测急性或以前的感染; 1~3小时 大型三甲
• 对于细菌,相近的抗原易发 交叉反应。
• 低成本
已知特定
• 检测特定感染;
病原微 • 快速;
• 成本高于培养的方法;
物验证 PCR[2,4] • 高灵敏度; 1~2小时 大型三甲 (新冠前)
• 受扩增偏差影响;
• 准确。
• 无法区分活细胞/死细胞。
芯片[10-11] • 中通量 • 结果稳定性、平行性差 4~8小时 几乎未开展
• 准确率、可靠性依赖于技术经验;
通常2~3天
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