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基因组甲基化:标记和它的介质
名字,学号
(XX学院,江苏徐州221000)
摘要:在DNA甲基化胞嘧啶环的五位发生在CpG二核苷酸的哺乳动物最基因组,是必不可少的胚胎存活率。随着目前巳知的几个关键蛋白,它巳成为可能的方法的生物学意义表观遗传系统通过生化和遗传学。结果,我们在我们的了解基因的机制甲基化是针对特定区域的基因组的甲基化CpG结合蛋白的解释。最近的研究阐明了脱氧核糖核酸的作用控制基因表达的甲基化加强与组蛋白修饰的联系染色质重塑。
关键词:生物;CHO细胞;蛋白质组学;转录组学;代谢组学;合理优化
基因组中的甲基化被发现生物包括原核生物和真核生物。在原核生物,DNA甲基化发生在胞嘧啶和腺嘌吟基地,包括主机的一部分约束系统(在文献[1]回顾)。在多细胞然而,真核生物,甲基化似乎只限于胞嘧啶碱基与压抑有关染色质状态和基因表达的抑制⑵。甲基化对小鼠的生存能力至关重要,因为DNA甲基转移酶的破坏性酶的杀伤力⑶。脱氧核糖核酸的一般机制甲基化抑制基因表达:第一,修饰胞嘧啶碱基可以抑制某些研究协会与同源的DNA识别因素序列⑸;第二,蛋白质识别甲基化CpG甲基化可以引起潜在的压抑DNA[6]。甲基CpG结合蛋白(Mbps)的使用转录共抑制分子的沉默转录并修改周围的染色质,提供甲基化与染色质重塑的联系和修改[刀。在这篇综述中,我们专注于我们的最新进展甲基化机制的认识有针对性的转录抑制和口译中的甲基化CpG信号Mbps的作用沉默基因表达。我们强调的例子哺乳动物系统,包括动物模型的研究,因为最近几次的评论已经讨论了基因的主题植物和真菌中的甲基化和沉默凶。
1TargetingDNA甲基化DNA甲基转移酶
DNA甲基转移酶哺乳动物DNA胞嘧啶甲基转移酶酶配合以他们的首选基因为基础的一般类衬底。从头甲基化酶Dnmt3a和DNMT3B主要负责介绍胞嘧啶。在非甲基化CpG位点甲基化之前,而维护甲基转移酶将预先存在的甲基化模式复制到新的复制过程中的脱氧核糖核酸链。四分之一脱氧核糖核酸甲基转移酶、DNMT2,显示弱的DNA甲基转移酶活性在体外[9],但有针对性地删除胚胎干细胞有着密切的基因无对全球甲基化的影响,这表明这种酶在设置核酸酶的参与程度不多甲基化模US。
DNMT3L是一种酶相关蛋白活性的影响不包含内在的DNA甲基转移酶的活性,但身体同伙DNMT3A和DNMT3B和调节其催化活性[瑚。结合,这些从头甲基转移酶似乎与维护构成脱氧核糖核酸的核心酶组分哺乳动物甲基化系统。
靶向从头甲基化的机制
是一种酶相关蛋白活性的影响不包含内在的DNA甲基转移酶的活性,但身体同伙DNMT3A和DNMT3B和调节其催化活性[12]。结合,这些从头甲基转移酶似乎与维护构成脱氧核糖核酸的核心酶组分哺乳动物甲基化系统。靶向从头甲基化的机制全球从头甲基化的例子已经很好记录在生殖细胞发育和早期胚胎发育过程中,当许多甲基化标记是再后基因组甲基化[13]阶段建立。这是很难学习的机制,DNA甲基转移酶酶被招募到有针对性的脱氧核糖核酸序列这些时代,由于少量的生物分子和生物化学研究的材料。大多数目前的知识,针对的脱氧核糖核酸因此甲基化从头因此来自细胞培养模型系统。这些研究至少表明三个可能的方法,从头甲基化可能有针对性的:第一,Dnmt3酶本身可能通过特定的域识别核酸或染色质,第二,DNMT3A和DNMT3B可能通过招聘与转录抑制蛋白相互作用的蛋白或其他因素;第三,核糖核酸干扰(RNAi)系统可能目标从头甲基化到特定的脱氧核糖核酸序列。在这里,我们考虑关于这些可能性的证据。在小鼠细胞,部分定位于Dnmt3酶着丝粒异染色质的地区。功能研究表明,保守的重构需要目标的催化活性。
这些地区,DNMT3A基因组。这一领域的重要性被高亮显示的发现,一个突变的人的重构使ICFDNMT3b蛋白综合征,严重的常染色体隐性遗传病人类[14]。突变废除正常染色质结合组织培养细胞[15]DNMT3B和原因经典卫星2甲基化的研究受影响的人的脱氧核糖核酸四。晶体结构,老鼠DNMT3BPWWP域已经解决,和在体外的证据表明,这一域可能会相互作用用序列独立的方式的核酸[11]。值得注意的是,PWWP域共享结构的相似性与都铎域发现53BP1,蛋白质结合组蛋白尾巴的H3赖氨酸79亚基的改性[18]。确定组蛋白是否有意思修改也参与了针对该基因通过他们的PWWP结构域的蛋白质。DNMTs也可以有针对性的内源性基因站点特定的转录抑制作用蛋白质。
这个想法是首次提出的致癌融合蛋白PML-rar,可以招募DNA甲基转移酶和甲基化的原因靶基因在肿瘤细胞中[19]。最近,Brenneret表明,Myc蛋白结合DNA甲基转移酶的活性,而直接DNMT3A和myc基因之间的相互作用是必需的该Myc靶基因p21Cip1有效压制。利用组织培养的染
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