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基于excel函数功能的kaplan-meian生存分析模板的编制
excel是office软件的主要组成部分,也是当前应用最广泛的电子表格软件。它具有较强的数据处理与分析能力, 丰富的图表功能, 在统计分析中有着广泛的应用。医学、药学工作者在工作和研究中经常需要对数据作统计分析, 尽管目前多种优秀的统计专业软件如SAS、SPSS等可供选用, 但是这些专业软件往往系统庞大、结构复杂, 其中大多数内容只适用于专业统计人员, 且价格不菲, 一般的应用者难以获得。本文根据Kaplan-Meier生存分析计算原理, 通过对Excel的模板编制, 实现对Kaplan-Meier生存分析的数据进行处理, 具有操作简单、学习与使用方便、数据分析精确的优点。
1 两组秩序的计算
对观察资料的描述常采用Kaplan-Meier生存曲线, 例如, 对某类肿瘤病人分别采用治疗组 (1) 、对照组 (2) 两种方案治疗, 随访资料如表1、表2的B、C、J、K列所示, “该病死亡例数”中1为完全数据, 代表因该病死亡, 0为截尾数据, 代表失访、迁出、非该病死亡或仍存活。
以治疗组为例, Excel计算过程如下。对“观察月数”、“该病死亡例数”按主要关键字“观察月数”升序、次要关键字“该病死亡例数”降序排序, 依次填写秩次。在单元格D3定义公式“=MAX (A:A) ”, 显示的计算结果是A上的最大数值, 即治疗组病例数总和。在单元格4定义公式“=D3-1”显示的计算结果是上一期初病例数减1。将D4的公式向下复制 (可用拖曳填充柄操作) 到D列的相应行, 使对A、B、C列所有数据产生计算 (如表1中复制到区域D5:D18的所有单元格) 。定义E3=C3/D3, F3=1-E3, G4=G3*F4, 将F3、F3、G4的公式向下复制到E、FG列的相应行, 使对A、B、C列所有数据产生计算, 显示的计算结果便是各秩次的死亡概率、生存概率、生存率。
对照组的计算与治疗组类。直接将表1相关单元格复制至I:O列, 把“表1”改为“表2”, “治疗”改为“对照”即可。
对表1、表2的观察月数、生存率数据使用图表向导采用“XY散点图”制图, 即可方便地得到Kaplan-Meirer生存曲线 (见图1) 。
2 计算logrank生存率差异的原则以及excel分析模型的编制
2.1 计算原理
2.2 理论死亡率计算
定义X4=T4*U4/W4, Y4=T4*V4/W4, 将X4、Y4的公式往下复制到X、Y列的相应行, 使对Q、R、S列所有数据产生计算, 即各组“理论病死数”为各组“期初病例数”与“期初病例数合计”的商与“该病死亡例数校正值”的乘积。
2.3 excel计算
3 分析模型的保存和使用
3.1 保存类型
辛苦创建并调试正确的模板应妥善保管。打开该Excel工作表, 单击“文件”工具栏, 单击下拉菜单“另存为”, 选择保存类型为“模板”, 文件名为“生存分析”, 保存, 即可。同时做好备份, 这样, 每次使用时可以通过模板创建新的工作表而不改变模板本身。
3.2 公式计算单元格的清除
运行Excel, 单击“通用模板”, 单击“生存分析”, 确定, 即可创建新的自下而上分析工作表。在表1、表2、表3中相应各列录入原始数据 (表3数据与表1、表2重复, 可通过复制粘贴减轻工作量) , 按要求排序, 如果数据的个数少于原模板的数据个数, 把多余的公式计算单元格清除内容, 即可。如果数据的个数多于原模板的数据个数, 把公式计算单元格的公式往下复制制相应行, 使对所有数据产生计算, 即可。
使用该模板时应注意两点。一是数据的录入必须逐例录入, 而不能把具有相同观察时间的数据合并当作一条数据录入。例如“观察月数”为11时治疗组有2例, 均该病死亡, 则在相应的“组别”、“观察月数”、“该病死亡例数”项下按行分别录入1、11、1;1、11、1。而不能录入1、11、2。因为在模板编制过程中默认每行的病例数为1, 否则”期初病例数“得手工录入, 操作更为繁琐。同时生存时间应尽可能精确, 因为该方法在生存时间排序的基础上作统计处理, 即使是小小的舍入误差, 也可能改变生存时间顺序而影响分析结果。二是在数据 (包括原始数据与计算数据) 下方的空白单元格处不得输入任何符号, 因为这些单元格可能参与计算, 从而导致对计算结果的干扰。
4 lograken生存率差别检验
4.1生存分析是医药学工作者一种重要且常用的统计分析方法, 掌握Kaplan-Meier生存分析计算原理, 通过对Excel的模板编制与使用, 实现对生存分析的数据进行处理, 具有操作简单, 学习与使用方便, 数据分析精确的优点。当生存曲线为3组或更多比较时, 对本分析模板稍作更改后使可同样适用。
4.2本模板经调
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