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3DNA复制;3.1DNA复制的基本原则
3.2DNA复制的方式
3.3DNA复制的酶类体系
3.4DNA复制过程
3.5端粒和端粒酶;3.1DNA复制的基本原则;第三章DNA复制2;1958年,Meselson及Stahl以大肠杆菌为实验材料,借助放射性同位素(15N)标记和CsCl密度梯度离心(Densitygradientcentrifugation)等技术首次证明了DNA的半保留复制模型的正确性;第三章DNA复制2;3.1.2DNA复制的半不连续性;DNA复制是以半不连续方式进行,一条链的合成按5′→3′方向连续合成,其合成方向与复制叉的移动方向一致,称为前导链(Leadingstrand),另一条链的DNA合成是在复制叉打开到一定程度后才开始的,先合成许多不连续的小片段(冈崎片段,Okazakifragment),最后合成一条完整的DNA链,称为后滞链(Laggingstrand)。;第三章DNA复制2;3.1.3DNA复制的引物;第三章DNA复制2;目的:保持DNA复制的高度忠实性。
原因:DNA聚合酶具有校正活性,而RNA聚合酶没有校正功能。在低保真引物完成功能后将其删除,而代之以DNA聚合酶Ⅰ指导合成的高保真DNA链。
结果:使DNA复制的准确性提高了105倍。;3.1.4DNA的双向复制;第三章DNA复制2;3.2DNA复制的方式;3.2.1θ型复制
原核生物DNA从起始点开始复制,随着复制叉向前推进,复制区域就像在非复制区域内产生气泡并不断扩大,形成θ结构。
Cairns揭示了大肠杆菌DNA的θ型复制过程。;第三章DNA复制2;3.2.2滚环复制
有些环状DNA以滚环模式复制,即双链中的一条链产生一个缺口,DNA聚合酶从缺口上的3′端开始,以另一条完整链为模板进行链的延伸,这样新合成的链将替代原来的亲本链,好象模板环在不断滚动。(图3-7A);图3-7B:噬菌体ΦΧ174的单链DNA首先形成双链的复制型(Replicativeform),在DNA正链的复制起始点上进行单链切断,5′端与A蛋白相连,DNA聚合酶Ⅲ以未切断的负链为模板,从正链的3′端开始不断延伸进行复制,5′端却不断地脱离环状模板被剥离出来,成为越来越长的游离单链。当复制回到起始点时,具有内切酶活性的A蛋白切割起始点并结合于新的5′端,被替代的正链以环状形式释放。;第三章DNA复制2;3.2.3D环复制
线粒体和叶绿体的双链环状DNA从特殊位点开始解链,但两条亲代链中只有一条作为模板(H链)合成新链,开始复制出一小段DNA,取代了原来的互补链(L链),这样一条单链和一条双链组成的结构,称为置换环(Displacementloop)或D环。随着复制的继续进行,D环不断扩大,L链被不断置换,直至L链上的起始位点暴露,开始新的H链的合成。因此双链DNA的两条链分别有自己不同的Ori。;第三章DNA复制2;3.3DNA复制的酶类体系;表3-1大肠杆菌DNA聚合酶的比较;DNA聚合酶Ⅰ主要作用是在DNA复制的过程中负责清除RNA引物,该功能依赖于其5′→3′外切酶活性。
DNA聚合酶Ⅰ的“缺口平移”过程可用于制备放射性标记核酸探针。
DNA聚合酶Ⅰ经枯草杆菌蛋白酶处理后产生的大片段称为Klenow片段,失去了原来的5′→3′外切酶活性。;第三章DNA复制2;DNA聚合酶Ⅲ至少包含10个亚基。
α、ε、θ三个亚基构成的催化核心,α亚基具有5′→3′聚合酶活性,ε亚基具有3′→5′外切酶活性,θ亚基负责激活外切酶活性。
两个β亚基形成“夹钳”(Clamp),套在DNA模板上,在复制时沿着模板滑动,防止聚合酶从DNA上脱离。
二聚化亚基τ使两个催化核心连接在一起。
由γ2δδ′χψ组成的γ复合体作为夹钳装载机(Clamploader),负责将β亚基结合到DNA上。
因此,DNA聚合酶Ⅲ是一个不对称的二聚体,每个单体都具有一个催化核心、一个二聚化亚基、一个具有前进能力的亚基,能同时催化两条DNA链的合成;第三章DNA复制2;3.3.1.2解旋酶(Helicase)
解旋酶能利用水解ATP产生的能量使DNA解链。
在大肠杆菌中,有12种不同的解旋酶。
解旋酶通常是多聚体,典型的是六聚体结构。;第三章DNA复制2;3.3.1.3单链结合蛋白(Single-strandbindingprotein,SSB)
单链结合蛋白结合并保护DNA单链,阻止其恢复成双链体状态。
SSB一般以单体形式结合,但结合具有协同性。
大肠杆菌的SSB是一个四聚体。;3.3.1.4DNA连接酶(DNAligase)
大肠杆菌的DNA连接酶分子量为74000
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