章超越遗传密码信息传递糖生物化学1 sugar code.pdfVIP

章超越遗传密码信息传递糖生物化学1 sugar code.pdf

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摘要基因工程时代,克隆和基因测序的发展极大地关注到了遗传编码的信息传递然而,要想全面了解细胞的识别过程及其内核蛋白质与核苷酸之间的相互作用,还需要深入理解一系列更为复杂的信息结构系统此外,基于氨基酸和蛋白质的三个分子级系统逐渐形成更强大的代码系统,其存储信息的单元数量远远超过其他物质,即单词或句子同时,通过分析纳米级有机聚合物和寡糖中的异构体,研究人员已经揭示了小分子化合物中能多次存在不同类型的低能量形式键这一发现有助于证明“差异性conformerselection”现象的存

Chapter10

BiologicalInformationTransferBeyond

theGeneticCode:TheSugarCode*

Hans-JoachimGabius

Intheeraofgeneticengineering,cloning,andgenomesequencing,the

focusofresearchonthegeneticcodehasreceivedanevenfurtheraccentuationin

thepubliceye.When,however,aspiringtounderstandintra-andintercellular

recognitionprocessescomprehensively,thetwobiochemicaldimensionsestablished

bynucleicacidsandproteinsarenotsufficienttosatisfactorilyexplainallmolecular

eventsin,e.g.celladhesionorrouting.Tobridgethisgapconsiderationoffurther

codesystemsisessential.Athirdbiochemicalalphabetformingcodewordswith

aninformationstoragecapacitysecondtonoothersubstanceclassinrathersmall

units(words,sentences)isestablishedbymonosaccharides(letters).Ashardware

oligosaccharidessurpasspeptidesbymorethansevenordersofmagnitudeinthe

theoreticalabilitytobuildisomers,thenthetotalofconceivablehexamersiscalculated.

Beyondthesequencecomplexityapplicationofnuclearicresonance(NMR)

spectroscopyandmolecularmodelinghavebeeninstrumentaltodiscoverthateven

smallglycanscanoftenresideinnotonlyonebutseveraldistinctlow-energy

conformations(keys).Intriguingly,conformerscandisplaynotablydifferent

capacitiestofitsnuglyintothebindingsiteofnonhomologousreceptors(locks).

Thisprocesperimentallyverifiedfortwoclassesoflectins,istermed

“differentialconformerselection.”Itaddspotentialforshiftsoftheconformer

equilibriumtomodulateligandpropertiesdynamicallyandreversiblytothewell-

knownchangesofsequence(includinganomericpositioningandlinkagepoints)

andofpatternofsubstitution,e.g.bysulfation.Intheintimateinterplaywithsugar

receptors(lectins,enzymes,andantibodi

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