《 蛋白质相关计算(二)》精品课件.pptxVIP

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第2章组成细胞的分子

第4节蛋白质相关计算

目录1数量关系分析2蛋白质相对分子质量计算3蛋白质中C、H、O、N原子数目计算

1数量关系分析

1.1水分子数与蛋白质中肽键数及氨基酸数目的关系多肽链形成蛋白质肽键数=氨基酸数-1脱去的水分子数=H2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2OH2O公式:脱去水分子数=肽键数=氨基酸数-肽链数肽键数=氨基酸数-2脱去的水分子数=

1.1水分子数与蛋白质中肽键数及氨基酸数目的关系环状多肽形成蛋白质公式:脱去水分子数=肽键数=氨基酸数

1.2蛋白质中游离氨基、羧基数目与肽链的关系多肽链形成蛋白质H2NCOOH游离羧基数=1游离氨基数=H2NH2NCOOHCOOH游离羧基数=2游离氨基数=R1R2R3R4R5R6R7R8R9R10公式:蛋白质中至少含有的游离的氨基或羧基数=肽链的条数公式:蛋白质中含有游离氨基/羧基数=肽链的条数+R基中游离氨/羧基

1.2蛋白质中游离氨基、羧基数目与肽链的关系环状多肽形成蛋白质公式:蛋白质中至少含有的游离的氨基或羧基数=0公式:蛋白质中含有游离氨基/羧基数=R基中游离氨/羧基

2蛋白质相对分子质量计算

CHCOOHR2HN二肽CHR1H2NOHCOH肽键H2O2.蛋白质相对分子质量计算脱水缩合

CHCOOHR2HNOHHCCHR1H2NCOCHR2HNOH2OH2O肽键肽键三肽2.蛋白质相对分子质量计算公式:蛋白质相对分子质量=氨基酸数×氨基酸平均相对分子质量-脱去的水分子数×18

2.蛋白质相对分子质量计算公式:蛋白质相对分子质量=氨基酸数×氨基酸平均相对分子质量-脱去的水分子数×18-二硫键数×2图2-1某胰岛素通过二硫键连接蛋白质中存在二硫键S二硫键HHH2S

3蛋白质中原子数目计算

N原子数=各氨基酸中的N原子总数=氨基酸数+R基上的N原子数=肽键数+肽链数+R基上的N原子数CHCR1H2NONHCHCR2ONHCHCR3ONHCHCR4ONHCHCR5ONHCHCR6ONHCHCOOHR73.1N原子数

O原子数=各氨基酸中O原子总数-脱水数=肽键数+肽链数×2+R基上的O原子数CHCR1H2NONHCHCR2ONHCHCR3ONHCHCR4ONHCHCR5ONHCHCR6ONHCHCOOHR73.2O原子数

=氨基酸数×2+R基上的C原子数C原子数=氨基酸中的C原子数CHCR1H2NONHCHCR2ONHCHCR3ONHCHCR4ONHCHCR5ONHCHCR6ONHCHCOOHR73.3C原子数

H原子数=各氨基酸中的H总数-脱水数×2CHCR1H2NONHCHCR2ONHCHCR3ONHCHCR4ONHCHCR5ONHCHCR6ONHCHCOOHR73.4H原子数-2×二硫键数

计算原子数量时,由于R基上的C原子数不好确定,且H原子数较多,经常以N原子数或O原子数或者S原子为突破口,计算氨基酸的分子式或氨基酸个数最为简便。计算蛋白质的相对分子质量时,肽链上出现二硫键(—S—S—)时(二硫键由—SH和—SH脱去2个H形成),要再减去2(即两个氢原子),若无特殊说明,则不考虑二硫键。3.5原子数计算注意事项

4练习与应用

1965年,中国科学家在世界上第一次用人工方法合成了具有活性的结晶牛胰岛素。该胰岛素有17种、51个氨基酸形成两条肽链而组成的。其中A链含有21个氨基酸、B链含有30个氨基酸。脱水数=肽键数=氨基酸数-肽链数=51-2=494.练习与应用

含有21个氨基酸含有30个氨基酸该胰岛素中至少含有_____个游离的氨基;_______个游离的羧基224.练习与应用

该胰岛素的相对分子质量=氨基酸的数量×氨基酸的平均相对分子质量-脱水数×18-二硫键数×2=51×氨基酸的平均相对分子质量-49×18-3×24.练习与应用

下图为某蛋白质的结构示意图,该蛋白质分子共由m个氨基酸组成,则形成1个该蛋白质分子时生成的水分子数和减少的相对分子质量分别为()√m,18m (m-4),18(m-4)(m-3),18(m-3)+4(m-2),18(m-2)+44.练习与应用

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