流行病学-分子流行病学.pptx

;基本概念

主要研究内容

常用技术方法

应用实例;分子流行病学

（MolecularEpidemiology）;产生背景;;分子流行病学与传统流行病学的关系;分子流行病学的特点;血清流行病学和人类基因组流行病学;分子流行病学是流行病学的一个分支

(分子生物学？群体遗传学？);;生物标志(biologicalmarkers,biomarkers)是指从暴露到疾病这个连续过程中可测量的，能反映功能或结构变化的细胞、亚细胞、分子水平的物质。

分子生物标志物(molecularbiomarkers)直接反映外来理化因素与细胞靶分子,特别是生物大分子如核酸和蛋白质的相互作用及其后果,是生物标志的主要部分。

;研究内容;暴露标志（exposuremarker）;效应标志（effectmarker）;易感性标志（susceptibilitybiomarker）;;人类基因组遗传变异;生物学意义:不同个体的基因99.9%是一样的，但在序列上有极小(0.1%)的遗传差异，其中主要是单核苷酸多态性(SNP)。这0.1%的差异授予你我他特有的表型；与个体对疾病的易感性、对药物的反应性差别有密切关系。

普遍性:SNP是指在人群中出现的频率?1%的先天突变。SNP存在于整个人类基因组中，每100bp以内就存在一个SNP，估计总数在数百万个。

对于人群研究而言的技术可及性和稳定性:Platformanddatabase;;基因型检测-

危险度评价、

个体化治疗;分子流行病学常用技术及方法;个体化治疗的途径;AutomatedLiquidHandler

SpectroPREPTM;基因组研究的平台;;Hi-Seq;全基因组关联研究(GWAS);二代测序（NGS）;基因组测序价格显著下降;MetagenomicSequencing;IntegratedGenomics;分子流行病学在疾病预防和控制中的应用;案例：1990年7月，美国佛罗里达州一名AIDS妇女，怀疑在当地一牙科诊所手术时感染了HIV，因为该诊所的牙科医生也是一名AIDS患者。随后当地卫生部门对该牙医诊治过的一千余名患者进行HIV检测，共发现7名HIV感染者有在该诊所的就诊史。

;针对这一问题可采取的分析方法：

1、传统流行病学分析方法：接触者调查，分析感染者可能的危险行为如输血、静脉吸毒、不洁性交史等。

2、分子流行病学方法：比较HIV病毒基因序列的差异，分析不同病例感染株遗传关系的远近。;;;2.非传染病的病因及病因致病机制的研究

例：血???与心血管疾病

吸烟导致肺癌的作用机制

基因表达与疾病的发生与转归、个体化治疗

;;;;TheAngelinaeffect;HypothesisDrivenApproach！

（Candidategenes）;;LinkageDisequilibrium(LD)based-mapping

Sequence-basedselectionapproach

basedonSNPlocationandpotentiallyfunctionalrelevance;;;GWAS研究策略;;SevenYears，Morethan1600publishedGWAShavereportedabout2000robustassociationsfor300traits;ReportedGWASofLungCancer;Heterogeneityamongethnicities;Only5p15locusisreplicatedinChinese;SimilarresultswerereportedinJapanese;;鳞癌特异的位点;SignificanceofGWASFindings(I);SignificanceofGWASFindings(II);Previousunknownpathogenicpathways:autophagyinCrohn’sdisease,IL-23pathway(GWAstudies:rewritingthestoryofIBD.TrendsGenet.2009).

Clinicalusage:GWASfindingshavebeenorprobablywillbevaluableindiseaseprediction(type1diabetes,AUCabout0.9),biomarkeri