《生物信息学》课程教学大纲.docx

《生物信息学》课程教学大纲

一、课程信息

课程代码（COURSECODE）

319B1253

课程名称（COURSETITLE）

生物信息学

课程性质（COURSECHARACTER）

选修

学分（CREDIT）

2

周数（WEEKS）

12

学时（CONTACTHOURS）

24+16

先修课程（PRE-COURSE）

动植物学，生物化学，遗传学，分子生物学

课程负责人（COURSECOORDINATOR）

适用专业

生物科学

课程简介（300字左右）：

《生物信息学》课程教学目的是使学生了解生物信息学的概念和发展历史、生物信息学的生物学基础、生物信息学的计算机和网络基础、生物信息学的数学基础、生物信息学的产业化、生物信息学研究内容和前景展望；对数据分析软件的应用。

课程主要内容包含：生物信息学概论，了解生物学数据库，核酸序列的信号和功能识别，蛋白质序列分析与结构预测方法，核酸和蛋白质序列的进化分析，基因组测序与分析，功能基因组信息学。

该课程的教学目标是使学生对相关网络资源的使用能力，使学生拥有强大的搜索功能实现数据储存、检索和分析。

二、课程目标（理论、实验课程填写）

通过本课程的学习，学生应具备以下几方面的目标：

1.生物信息学概论，了解生物信息学的概念和发展历史、生物信息学的生物学基础、生物信息学的计算机和网络基础、生物信息学的数学基础、生物信息学的产业化、生物信息学研究内容和前景展望。

2.分子生物学数据库，了解生物学数据库，核苷酸序列与基因组数据库，蛋白质序列与模式、同源性数据库，结构数据库，基因和分子的互作和代谢途径信息数据库，RNA核苷酸序列数据库，其它遗传学与分子生物学资源，及数据库中存在的问题及使用注意事项。

3.序列比对与数据库检索，了解序列比对，双序列比对，比对的统计学显著性，多序列比对，数据库搜索，基因组长序列比对。

4.核酸序列的信号和功能识别，了解DNA序列的统计学与信息学分析，密码子指纹与密码子使用偏好性分析，编码DNA片段的长度与GC含量，重叠基因的信息论问题，功能相关基因在两个基因组间或内部的聚类关系，真核生物的基因表达调控，蛋白质基因识别，核酸序列的特殊信号检索，编码序列翻译，PCR引物和寡核苷酸探针设计，RNA标纹识别和局部结构配对。

5.蛋白质序列分析与结构预测方法，了解多肽理化性质计算与预测，蛋白质家族与蛋白质分类，蛋白质序列模式和结构域模式分析，蛋白质结构预测与分子设计。

6.核酸和蛋白质序列的进化分析，了解分子系统发育，统发育模型的组成，系统发育数据分析的一般步骤，建立数据模型（比对），建树方法，进化树搜索，确定树根，评估进化树和数据，系统发育软件(MEGA2,PAUP*,MACCLADE,PHYLIP)。

7.基因组测序与分析，了解DNA测序与序列片段的拼接，编码蛋白质基因区域的预测，基因组的比较，基因组物理图谱与测序，Conting图或克隆定序，有序鸟枪测序作图的分析；

8.功能基因组信息学，了解功能基因组信息学及基因表达数据分析。

课程目标对毕业要求的支撑关系表

毕业要求

毕业要求指标点

课程

目标1

课程

目标2

课程

目标3

课程

目标4

课程

目标5

课程

目标6

课程

目标7

课程

目标8

毕业要求1：能够将教育教学的基础理论和知识用于分析和解决生物学教学过程或教学实践中出现的问题，并得出合理的结论；

1.1掌握教育学、心理学和教育心理的知识

H

1.2掌握教育教学的基本理论和方法，能对教学问题进行适当的表述

L

1.3了解教学过程和规则，具有初步分析教学过程或教学实践中出现问题的能力

L

M

1.4能够运用教学规律与理论解决教学中的问题，得出合理结论

H

L

毕业要求2：能够把生物科学的基础理论、基本知识和基本技能，应用到教育活动过程中，设计出符合教育教学规律的方案，并在有关设计环节中追求创新意识，同时，能分析和评价设计方案对教育教学和社会的影响；

2.1掌握教学的基本原理，具备初步构建或设计教学方案的能力

L

L

2.2理解生物学基本概念和理论，掌握生物的形态结构和生理功能，能将掌握的知识用于解释生物现象和教学实践

H

L

M

2.3具备理解教学过程和教学规则的能力，具备对教学方案和设计进行评价的能力

L

L

H

毕业要求3：初步掌握生物学研究方法和手段，学会利用实验仪器和分析工具获取、分析和解释科学数据，进行实验设计和研究，并能将获得的成果应用于教学和创业实践。

3.1掌握生物学实验技能，具备实验操作的基本能力

L

M

3.2初步具备实验设计和优化的能力

H

H

3.3掌握现代实验仪器和分析工具，获取和分析实验数据的能力

H

L

3.4了解影响实验的制约因素，根据所得的数据对实验过程进行优化，并将成果用于教学和创业实践

H