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NatA复合体的功能及氧化钇纳米颗粒植物毒性的研究
中文摘要
蛋白质N末端的乙酰化修饰是真核生物蛋白质组中发现的最丰富的修饰之一,该修
饰由N末端乙酰转移酶催化完成。N末端乙酰转移酶以乙酰辅酶A作为乙酰基团的供
体,将激活的乙酰基部分转移到蛋白质的N末端α氨基上。蛋白质N末端乙酰化修饰
屏蔽了蛋白质N末端氨基所带的正电荷,改变了蛋白质N末端的极性进而影响蛋白功
能。N末端乙酰化修饰可以调控蛋白质的半衰期、影响蛋白质折叠、调控蛋白质与蛋白
质的相互作用和影响蛋白质的细胞质膜定位。蛋白质N末端乙酰化主要是共翻译修饰的
过程,N末端乙酰转移酶与核糖体锚定在一起,当蛋白质刚刚被翻译出20-50个氨基
酸的新生肽链时,N末端乙酰转移酶催化产生N末端乙酰化修饰。与蛋白质赖氨酸的乙
酰化修饰不同,N末端乙酰化是不可逆的修饰过程。
NatA复合体是真核生物中主要的N末端乙酰转移酶复合体,它包含一个催化亚单
位Naa10和三个辅助亚单位Naa15、HYPK和Naa50,当新生肽链N末端的起始甲硫氨
酸被氨肽酶切除,新形成的N末端的氨基酸残基是Ser、Ala、Thr、Gly、Val或者Cys
时,该新生肽链倾向被NatA复合体识别,进行N末端乙酰化修饰。在模式植物拟南芥
中,NatA复合体在生长发育和逆境响应中发挥重要的作用。拟南芥中Naa10和Naa15
的完全缺失会导致胚胎致死表型,也会导致胚乳细胞化严重延迟和不完全细胞化。NatA
复合体通过对SNC1蛋白的N末端乙酰化修饰,创造N末端的降解信号,介导SNC1
的降解,导致植物对病原菌的敏感表型。此外,在干旱胁迫下,拟南芥中蛋白质N末端
乙酰化修饰显著降低,NatA复合体的丰度也受到脱落酸处理的快速下调。到目前为止,
拟南芥中NatA复合体与底物蛋白之间的对应关系尚不明确。
在本文的研究中,我们利用邻近标记技术结合N末端乙酰化组学数据,对NatA复
合体的底物及识别底物的规律进行了探索。结果表明,在检测到的NatA复合体的底物
蛋白中,当起始甲硫氨酸被切除后,新形成的N末端氨基酸主要是Ala、Ser和Gly,这
与之前人们的推测一致。但是,NatA复合体的底物中还包括起始甲硫氨酸保留的底物,
并且第二个氨基酸主要是Glu和Asp。这些起始甲硫氨酸保留的底物占检测到的底物数
目的32.9%,而之前这些蛋白被推测是NatB复合体的底物。因此,相较于在酵母和人
细胞中,拟南芥NatA复合体的底物识别范围可能更广。
在拟南芥中,Naa50蛋白作为NatA复合体可能的组分,我们也对Naa50蛋白的功
能和表达调控进行了分析。结果表明,Naa50蛋白缺失突变体naa50-1相较于野生型拟
南芥表现出明显的主根生长缺陷。融合GFP标签的Naa50基因组DNA可以完全恢复
naa50-1突变体主根发育缺陷的表型,而Naa50基因自身启动子驱动融合GFP标签的
CDS序列仅部分恢复了naa50-1突变体主根发育缺陷的表型。进一步研究表明,Naa50
基因的内含子1的缺失导致Naa50在根尖分生区以及伸长区和成熟区的表皮、皮层和内
皮层中的表达缺失,而内含子2的缺失降低了Naa50在根伸长区和成熟区的表皮,皮层
和内皮层中的表达。Naa50基因自身启动子与内含子1和2共同促进Naa50在萼片维管
束、花丝、花粉和柱头中的表达;然而,两个内含子对成熟莲座叶中Naa50的表达都没
有促进作用。因此,Naa50基因中的内含子1和2作为增强子,促进Naa50的组织特异
性表达。
对氧化钇纳米颗粒(YO-NPs)的植物毒性分析过程中,发现YO-NPs处理拟南
2323
芥幼苗后,产生了与Naa50蛋白缺失突变体相似的表型。浓度超过2mM的YO-NPs
23
显著抑制了拟南芥幼苗根的生长。YO-NPs处理使Naa50蛋白的丰度轻微上调,使
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