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摘要
鱼腥藻苹果酸脱氢酶的酶学及生物信息学研究
摘要
苹果酸脱氢酶(malatedehydrogenase,MDH)主要参与三羧酸(TCA)循
++
环的最后一步,在辅酶Ⅰ(NAD)或辅酶Ⅱ(NADP)的作用下催化苹果酸与草酰乙
酸之间相互转化,在动物、植物以及细菌等生物中广泛存在,作为糖代谢的关键
酶之一,在能量生产以及多种代谢途径中起着至关重要的作用。本研究在大肠杆
菌(Escherichiacoli)中异源表达并纯化了鱼腥藻属(Anabaena)三个代表型菌
Anabaenasp.PCC7120Anabaenasp.PCC7108Anabaenasp.YBS01
株(、、)来源
的MDH,并分析其理化特征及酶学性质。
生物信息学分析显示,鱼腥藻MDH亚基的相对分子量在35kDa左右,且
蛋白质的稳定系数较差,属于不稳定蛋白。多重序列比对显示鱼腥藻MDH单个
亚基具有9个α-螺旋、14个β-折叠,在N端附近是具有一段典型的“GXGXXG”
罗斯曼折叠(Rossman-fold)基序。系统进化分析发现,蓝藻MDH与L-LDH的
MDHL-LDH
亲缘关系较近,在进化树分支上处于靠近根的位置,由此暗示与
可能起源于同一祖先,并分别朝着不同底物特异性方向演化。
凝胶过滤层析与SDS检测显示,鱼腥藻MDH是典型的同源二聚体,
其亚基大小约为35kDa。本实验中Anabaenasp.PCC7120MDH(Aa7120MDH)
与Anabaenasp.PCC7108MDH(Aa7108MDH)的最适催化反应pH均为7.5,
Anabaenasp.YBS01MDH(AaYBS01MDH)的最适pH为8.0;鱼腥藻MDH的最
适催化反应温度要高于多数已知其它来源MDH的最适温度,其中Aa7120MDH
的最适温度约为65℃,Aa7108MDH与AaYBS01MDH的最适温度均为75℃。
从热稳定性来看,Aa7120MDH的热稳定性要高于Aa7108MDH与AaYBS01MDH,
但鱼腥藻MDH相对于其它已知蓝藻MDH的热稳定性较差。
酶动力学研究显示,鱼腥藻MDH在催化草酰乙酸与苹果酸相互转化反应中,
更加倾向于将草酰乙酸还原成苹果酸方向的还原反应。并且实验发现,鱼腥藻
MDH既能够以NADH为辅酶催化反应,也可以NADPH为辅酶,即具有双辅酶
-1-1
依赖性特征。以NADH为辅酶时,Aa7120MDH的k/K值为0.3317μMs,
catm
-1-1
Aa7108MDH的k/K值为0.1020μMs,AaYBS01MDH的k/K值为0.1090
catmcatm
-1-1-1-1
μMs;以NADPH为辅酶时,Aa7120MDH的k/K值为0.09899μMs,
catm
-1-1
Aa7108MDH的k/K值为0.00920μMs,AaYBS01
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