第2章 蛋白质的结构.ppt

蛋白质二级结构总结二级结构刚性/柔性氢键数目重复结构形状?-螺旋刚性较强多有?-折叠刚性较强多有?-转角柔性较强少没有无规卷曲柔性较强少没有超二级结构与结构域由若干个相邻的二级结构单元（α-螺旋、β-折叠、β-转角及无规卷曲）组合在一起，彼此相互作用，形成有规则的、在空间上能够辨认的二级结构组合体，称为超二级结构，也称模体（motiff）。αα结构βαβ结构ββ结构（一）超二级结构1.αα（复绕α螺旋）主要由两股右手α螺旋彼此缠绕而成的左手超螺旋。存在于α-角蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白和纤维蛋白原中，也存在于球状蛋白质中。2.ββ由一级结构上连续的反平行β折叠通过紧凑的β转角连接而成。最简单的ββ折叠花式是β发夹结构，它只有两个β折叠股，两个β折叠股间通过β转角连接。由几个β发夹可以形成更复杂一些的ββ折叠花式，例如β曲折和希腊钥匙拓扑结构。3.βαβΒαβ单元：两段平行的β折叠股通过一段α-螺旋连接而形成的超二级结构。βαβαβ，又称Rossman折叠，存在于苹果酸脱氢酶，乳酸脱氢酶中。蛋白质中的几种超二级结构结构域是多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区，在较大的球状蛋白质分子中，多肽链往往形成几个紧密的球状构象，彼此分开，以松散的肽链相连，此球状构象就是结构域。最常见的结构域约含100～200个氨基酸残基，少至40个左右，多至400个以上。结构域1.结构域的定义2.结构域的大小卵溶菌酶的三级结构中的两个结构域?-螺旋?-转角?-折叠二硫键结构域1结构域2较小的蛋白质分子，结构域和三级结构往往是一个意思，也就是说是单结构域的。大的蛋白质分子可以由2个或更多个结构域组成。（三）三级结构三级结构是整个多肽链在二级结构、超二级结构和结构域的基础上盘旋、折叠，形成的特定的整个空间结构。球状蛋白质主要是由三级结构肽链构成。球状蛋白质的主要结构形成：1.全α-结构（反平行α螺旋）蛋白质2.α，β-结构3.全β-结构（反平行β折叠片）蛋白质4.富含金属和二硫键（小的不规则）蛋白质各段α螺旋通过反平行或者近于相互垂直的状态而连接，排列成层，再平行折叠，从而形成三级结构的构象基础，α螺旋占极大优势的结构。1.全α-结构整个肽链中α螺旋与平行β折叠片交替存在，卷曲成多层。（1）单绕平行β桶由8个平行β折叠股环形排列，在第1和第8两个折叠股之间借氢键键合形成一个闭合式内桶。2.平行α/β结构（2）双绕平行β片中间由4～9个平行的β折叠股或混合型的β折叠股构成的开放β片，其两侧由α螺旋和环状区段保护。黄素蛋白酶（3）全β－结构（反平行β折叠片）由反平行β折叠片排列而成，β链之间以常以β转角连接。主要存在于小分子蛋白质；正规的二级结构单元很少，富含金属元素或者二硫键，失去金属元素或者二硫键时就会失去其三维结构。细胞色素C3（仅含有一小段α螺旋）4.不规则结构类型纤维状蛋白与球状蛋白质的比较纤维状蛋白球状蛋白结构1）只有一种类型二级结构单元1）同时含有几种二级结构单元2）二级结构水平2）三级结构或四级结构水平3）多分子聚合成束、网或片层3）致密的球状或椭球状实体4）疏水基暴露4）疏水基埋藏在球内部，亲水基覆盖在球表面5）表面无功能部位5）表面有功能部位性质不溶于水、稀酸和稀盐易溶于水、稀酸和稀盐二个或二个以上具有独立的三级结构的多肽链(亚基)，彼此借次级键相连，形成一定的空间结构，称为四级结构。八、亚基缔合与四级结构?血红蛋白（四个亚基）大肠杆菌DNA酶Ⅲ（10种亚基组成的20聚体）亚基或亚单位(subunit)亚基与多肽链的关系：亚基是肽链，但肽链不一定是亚基。如胰岛素A与B链，通过二硫键连接成分子，这些肽链不能称为亚基。单独亚基，无生物学功能，当亚基聚合成为具有完整四级结构的蛋白质后，才有功能。亚基聚合的动力：疏水作用、离子键、氢键、二硫键**多肽链可以看成由无数个酰胺平面被Cα串联起来组成的肽平面环绕N—Cα键旋转形成的二面角称为Φ；肽平面环绕Cα—C键旋转的二面角称为Ψ。α-碳原子的二面角（φ和ψ）φψ当Φ(Ψ)旋转键两侧的主链呈顺式时，规定Φ(Ψ)=0°?从Cα沿键轴方向看，顺时针旋转的Φ(Ψ)角为