动物遗传学Chapter 7 Animal Genomics and Bioinformatics动物基因组学与生物信息学.pptVIP

Chapter7AnimalGenomicsandBioinformatics

第七章动物基因组学与生物信息学Outlineofthischapter本章内容DefinitionofGenomics基因组学的概念Mapsingenome基因组图谱Bioinformatics生物信息学：基因组序列的意义Genomicfeaturesandapplication基因组的特征和应用Significanceofgenomicsforbiologicalresearches基因组学对生物学研究的影响Genomics基因组学的概念基因组学(Genomics)在20世纪80年代起步基因组学的建立与基因组计划同步基因组学的内容Part1-Studyinggenomes研究方法Part2-Genomeanatomies基因组结构Part3-Howgenomesfunction基因组功能Part4-Howgenomesreplicateandevolve基因组复制与进化Mapsingenome基因组图谱动物基因组序列图的制作全基因组鸟枪法（wholegenomeshotgunapproach,WGS）顺序克隆测序法（orderedclonesequencing）基因组图谱Mapsingenome基因组图谱Linkagemaps遗传连锁图谱根据标记座位之间的重组率绘制GeneticmapsorPhysicalmaps遗传图谱或者物理图谱截止2013年10月,基因组完成测序Vertebrates脊椎动物10,000种Insects昆虫5,000种DomesticAnimals:chicken,cattle,swine,goat,duck,etc.家养动物：鸡、牛、猪、山羊、鸭等动物基因组序列图的制作Wholegenomeshotgunapproach全基因组鸟枪法(WGS)先测序后制图重复序列(sequencecontigs)Orderedclonesequencing顺序克隆测序法全基因组鸟枪法(WGS)人类全基因组鸟枪法(WGS)测序与组装人2号染色体各个contigs的DNA序列连接顺序克隆测序的策略利用DNA指纹寻找重叠Bioinformatics生物信息学：基因组序列的意义生物信息学所处理的对象是大规模的生物学数据生物信息学又称为计算生物学基因组序列比对基因寻找基因组组装蛋白质结构比对蛋白质结构预测基因表达预测蛋白质-蛋白质互作进化构模大鼠12号染色体280bp序列的BLAST结果一个编码蛋白质基因的特征特性描述人类基因组基因按功能划分的初步分类Genomicfeaturesandapplication基因组的特征和应用人类基因组的结构通过比较基因组学解码遗传信息功能基因组学基因的发现人类基因组的主要特征人类基因组的结构—同源性概念间接同源直系同源宿主同源通过比较基因组学解码遗传信息Comparativegenomics比较基因组学DNA序列蛋白质RNA人LEP基因和小鼠ob/Lep基因的比较基因的发现Openreadingframe开放阅读框(ORF)Codenbias密码子偏畸Positionalcloning位置克隆Associationanalysis关联分析Functionalgenomics功能基因组学Transcriptome转录组Proteome蛋白组Interactome互作组Chiptechniques芯片技术Proteome蛋白组Chiptechniques芯片技术人类疾病基因互作网络图Significanceofgenomicsforbiologicalresearches基因组学对生物学研究的影响从演化角度，基因组学可以深入了解基因组在地质时间尺度上如何分化和适应在生态学研究中，生物学家可以通过自然样本中基因组的存在和含量来分析生物的分布在基础细胞和分子生物学中，全基因组分析是系统生物学全局分析所有基因生理功能的基础在农业生产中，基因组学可以使人们更好地了解和利用经济性状的遗传基础在人类遗传学中，基因组学可以为定位众多致病基因提供新方法最新报道1092个人的基因组遗传变异整合遗传图谱非洲、亚洲、欧洲和美洲14个民族的1092个个体这些变异与很多疾病