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88研究论文2024年第1期
DOI:10.19462/ki.zgzy.20231103004
蓖麻PIP5K1基因克隆、生物信息学及功能分析
11111111,2
李明静袁朴芳罗蕊尹明达王志妍户雪妹顾晓慧黄风兰
12
(内蒙古民族大学生命科学与食品学院,通辽028000;内蒙古自治区蓖麻育种国家民委重点实验室/
内蒙古自治区蓖麻育种与综合利用重点实验室/蓖麻产业技术创新内蒙古自治区工程研究中心/
内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心,通辽028000)
摘要:蓖麻PIP5K1基因在植物生长发育和抗逆过程中起重要作用。为探究蓖麻PIP5K1基因在蓖麻物种中的生物学功
能和不同时期雌性植株中的表达情况,以aLmAB2品系的蓖麻花序为试验材料,克隆PIP5K1基因,对该基因编码的蛋白质进
行生物信息学分析,并对PIP5K1基因在不同时期雌性系植株的表达模式进行分析。结果表明:从蓖麻花序轴顶端将总RNA
提取出来,并将其反转录成cDNA,克隆后得到一个全长为2325bp的PIP5K1基因片段,经测序后比对这一基因序列和NCBI
参考基因序列相同。对该基因所编码蛋白展开生物信息学分析,确定PIP5K1基因所编码蛋白质的氨基酸等电点为8.85,氨基
酸数目为774,分子量大小为87967.37Da,是一种亲水性稳定蛋白;无跨膜螺旋区,属于非跨膜蛋白;蛋白质二级结构由α螺
旋、β转角、伸展链及无规卷曲构成;三级结构与二级结构预测结果一致;与同属于大戟科的木薯亲缘关系较近,与其他科亲
PIP5K1PIP5K1
缘关系较远。qRT-PCR分析表明,在标雌系、单雌系、两性系花序中均有不同程度的上调和下调,推测基因参
与蓖麻花序发育的调控。本研究为探究PIP5K1基因促进蓖麻植株的生长发育机制奠定了理论基础。
PIP5K1
关键词:蓖麻;;基因克隆;生物信息学分析;功能分析
Cloning,BioinformaticsAnalysisandFunctionalAnalysisofCastorPIP5K1Gene
11111
LIMingjing,YUANPufang,LUORui,YINMingda,WANGZhiyan,
111,2
HUXuemei,GUXiaohui,HUANGFenglan
1CollegeofLifeSciencesandFoodEngineeringInnerMongoliaMinzuUniversityTongliao028000InnerMongolia2Inner
(,,,;
MongoliaKeyLaboratoryofCastorBreedingoftheSt
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