水稻OsUSPase基因的生物信息学分析及其表达分析.pdfVIP

分子植物育种，2024年，第22卷，第24期，第8014-8022页

MolecularPlantBreeding.24,8014-8022

研究报告

ResearchReport

水稻OsUSPase基因的生物信息学分析及其表达分析

张雯琦1*王新猛？

1江苏开放大学环境生态学院，南京，210036;2东南大学材料科学与工程学院，南京，211189

*通信作者,zhangwq@

摘要二磷酸尿苷糖焦磷酸化酶(USPase)是合成UDP-Glc的关键酶，而二磷酸尿苷糖在细胞生命活动中

发挥着重要作用。目前，USPase酶基因已在拟南芥、豌豆和大豆等植物中鉴定，但在水稻中尚未有相关报道。

本研究基于已报道的拟南芥USPase酶蛋白的氨基酸序列，通过同源预测的方法从水稻基因组上预测获得

水稻USPase酶基因，通过生物信息学手段分析其理化特性、信号肽、二级结构、亚细胞定位和三级结构等，

并成功克隆获得该基因。利用定量PCR技术分析了OsUSPase基因在水稻中主要营养元素缺乏条件下的表

达特征，发现其在叶片中受缺磷强烈特异诱导表达。在此基础上，展开进一步研究发现OsUSPase在叶片和

叶鞘中均受缺磷信号调控，表达出现显著上调，并且表达丰度随着缺磷时间的延长而逐渐增强。当恢复供磷

后，该基因的表达迅速受到抑制。本研究可以为水稻OsUSPase基因的理化功能和分子作用机制等研究提供

理论基础。

关键词水稻；二磷酸尿苷糖焦磷酸化酶；OsUSPase；生物信息学分析；基因表达分析

BioinformaticsAnalysisandExpressionAnalysisofgeneOsUSPaseinRice

ZhangWenqil*WangXinmeng

1CollegeofEnvironmentandEcology,JiangsuOpenUniversity,Nanjing,210036;2SchoolofMaterialsScienceandEngineering,SoutheastUniversi-

ty,Nanjing,211189

*Correspondingauthor,zhangwq@

DOI:10.13271/j.mpb.022.008014

J.mpb.022.008014

AbstractUridinediphosphatesugarcokephosphorylase(USPase)isakeyenzyme,synthesisofUDP-Glcand

uridinephosphatesugarplayanimportantroleincelllifeactivities.Atpresent,theUSPaseenzymegenehasbeen

identifiedinplantssuchasArabidopsis,peaandsoybean,buthasnotbeenreportedinrice.Thisresearchisbased

onthereportedaminoacidsequenceofArabidopsisUSPaseprotein.ThericeUSPasegenewaspredictedfromthe

ricegenomebyhomologypredictionmethod,anditsphysicalandchemicalproperties,signalpeptides,secondary

structure,subcellularlocalizationandtertiarystructurewereanalyzedbybioinformatics.OsUSPasegenewassuc-

cessfullyclonedinthisresearch.TheexpressionpatternofOsUSPaseinresponsetomainnutritiondeficiencywas

analyzedbyRT-qPCR,andtheresultsshowedthatitwasstronglyandspecificallyinducedbyphosphorusstarva-

tioninleaves.Onthisbasi