基于生物信息学方法对HDACi治疗黑色素瘤的免疫学机制探讨.pdfVIP

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·实验研究·

文章编号1671-2722渊2025冤01-0077-05

基于生物信息学方法对HDACi治疗黑色素瘤

的免疫学机制探讨

1223332

苏俊袁战杰袁王思夏袁景艺迪袁龙友琪袁武睿睿袁孙鹏

（1.汝南县人民医院医务部，河南汝南463300；2.沈阳医学院附属中心医院手外四科，辽宁沈阳110024；

3.沈阳医学院，辽宁沈阳110024）

摘要目的利用生物信息学分析方法对基因芯数据进行分析袁筛选出影响黑色素瘤发生发展过程

的核心基因和关键通路袁探其分子机制并发现黑色素瘤潜在生物标志物袁为分子诊断靶向治疗

和预后评估提供线遥方法从基因表达数据库(GEO)筛选数据集袁利用GEO2R分析黑色素瘤组

织和正常皮肤组织显著差异表达基因袁通过GEPIA平台对TCGA-SKCM和GTEx联合进行差异

表达分析遥使用Biovemn获得三组数据共有差异基因袁对其进行GO功能注释KEGG富集进行蛋

白互作分析筛选关键基因袁探讨HDACi治疗黑色素瘤的免疫学机制遥结果从GSE3189和

GSE15605以及TCGA-SKCM和GTEx联合有交集的差异表达基因有1015个遥主要涉及表皮发

育细胞群体增殖的负调控上皮细胞分化循环系统流程血液循环皮肤发育有机羟基化合物代

谢过程超分子纤维组织负调节细胞粘附细胞组分形态发生曰主要存在于细胞外基质外部封装结

构Collagen-containing细胞外基质细胞间连接角质化包膜细胞基部基底质膜顶端的一部分细

胞顶端质膜管基底等离子体膜曰主要富集在肌动蛋白结合钙离子结合分子功能抑制剂活动细

胞外基质的结构组成酶抑制剂的活动跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性肌动蛋白丝绑定跨膜受体

蛋白激酶活性蛋白质酪氨酸激酶活性酶调节活动遥以及显著涉及到的免疫和炎症的通路有癌症

的转录失调人乳头瘤病毒感染致病性大肠杆菌感染PPAR信号通路花生四烯酸代谢通路袁互

作较强的核心差异基因有EGFRERBB2CD34PPARGSOX9CDKN2AEPCAMAURKA

CCNB1SPP1遥结论癌症的转录失调人乳头瘤病毒感染致病性大肠杆菌感染PPAR信号通路

花生四烯酸代谢通路可能是HDACi治疗黑色素瘤的免疫学机制关键通路袁EGFRERBB2CD34

PPARGSOX9CDKN2AEPCAMAURKACCNB1SPP1等基因可能在其发挥着关键作用遥

关键词黑色素瘤曰生物信息学分析曰HDACi曰免疫学机制

doi:10.3969/j.issn.1671-2722.2025.01.020

AnbioinformaticsapproachtoexploretheimmunologicalmechanismofHDACIinthe

treatmentofmelanoma

SUJun,ZHANJie,WANGSixia,etal

(DepartmentofMedical,ThePeoplesHospitalofRunan,Runan,Henan,463300,China)

Abstract:ObjectiveToscreenthecor