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2024年第2期牡丹江师范学院学报(自然科学版)No.2,2024
(总第127期)JournalofMudanjiangNormalUniversityTotalNo.127
文章编号:1003-6180(2024)02-0036-07
欧洲油菜miR172靶基因预测及生物信息学分析
*
温鑫,魏继承,曲云,汪凯,任如意,郝爱平
(牡丹江师范学院生命科学与技术学院,黑龙江牡丹江157011)
利用生物信息学方法对欧洲油菜(BrassicanapusL.)的miR172(简称Bna-miR172)基因家族成员
摘要:
进行前体序列二级结构预测、序列保守性分析、系统发育进化树分析、靶基因预测及组织特异性表达分
析.Bna-miR172基因家族的二级结构为稳定的茎环结构;Bna-miR172家族成员的成熟序列高度保
守,前体序列在产生成熟序列的位置高度保守;系统进化树分析表明,Bna-miR172基因家族与Bju-
miR172基因家族的亲缘关系相近.Bna-miR172基因家族成员的靶基因以AP2类转录因子为主,推
测靶基因的功能主要是参与植物的成花作用、植株发育以及植物的逆境胁迫响应.
miR172;欧洲油菜;生物信息学;AP2
关键词:
S565.4A
[中图分类号][文献标志码]
EuropeanRapeseed
*
WENXin,WEIJicheng,QUYun,WANGKai,RENRuyi,HAOAiping
(MudanjiangNormalCollege,CollegeofLifeScienceandTechnology,Mudanjiang157011,China)
Inthispaper,bioinformaticsmethodswereusedtopredictthesecondary
Abstract:
structure,sequenceconservation,phylogenetictr,targetgenepredictionandtissue
specificexpressionofmiR172(Bna-miR172)genefamilymembersinEuropeanrapesd
Brassicanapus
(L.).ThesecondarystructureofBna-miR172genefamilyisstable
stem-ringstructure.ThematuresequencesofBna-miR172familymemberswerehighly
conserved,andtheprecursorsequenceswerehighlyconservedatthelocationswherethe
maturesequenceswereproduced.PhylogenetictranalysisshowedthatBna-miR172
genefamilywascloselyrelated
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