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卤虫休眠卵的形态卵壳部分包括3层结构，最外层是咖啡色硬壳层。硬壳层的主要成分是脂蛋白、几丁质和正铁血红素。硬壳层在结构上又可分为表面相对致密的表层和其下相对疏松的蜂窝状层。硬壳层的主要功能是保护其内的胚胎免受机械和辐射的损伤。这层壳也可以被一定浓度的次氯酸盐溶液氧化除去。

中间层为外表皮膜，外表皮膜由特殊过滤功能的多层薄膜构成，具有筛分作用，能阻止相对分子质量比二氧化碳大的物质渗透入膜，从而起保护胚胎的作用。壳的最内层为胚表皮，这是一层透明的富有弹性的膜，可分为纤维质层和与胚胎相邻的内表皮膜两层。

膜内的胚胎为一约有4000个细胞的原肠胚。

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