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武育粳3号背景下镇稻88CSSL群体构建及性状QTL检测研究

一、引言

1.1研究背景与意义

水稻（OryzasativaL.）作为全球最重要的粮食作物之一，为全球超过一半人口提供主食，在保障粮食安全、推动经济发展以及传承文化等方面发挥着核心作用。中国是水稻种植大国，水稻生产在农业经济中占据重要地位。随着人口增长和耕地面积减少，提高水稻产量和品质，增强其抗逆性，成为水稻遗传育种领域的关键任务。

构建染色体片段置换系（ChromosomeSegmentSubstitutionLines，CSSL）是水稻遗传研究和育种的重要手段。CSSL是通过多次回交和分子标记辅助选择，将供体亲本的染色体片段导入受体亲本基因组中，形成一套遗传背景一致，仅在个别染色体片段上存在差异的近等基因系群体。这种群体能够有效地消除遗传背景干扰，使目标基因的效应得以准确显现，有助于精细定位和克隆控制重要农艺性状的基因，为水稻遗传改良提供理论基础和基因资源。

武育粳3号是一种来源于江苏省高邮市的杂交水稻新品种，具有高产、中早、耐病等优良特性。镇稻88同样具备诸多优良性状，以武育粳3号为背景构建镇稻88CSSL群体，能够将镇稻88的优异基因导入武育粳3号遗传背景中，挖掘和解析控制水稻重要农艺性状的遗传基础，为水稻新品种选育提供新的种质资源和理论依据。

异交性状和穗部性状是影响水稻产量和品质的重要因素。异交性状如柱头外露率、开颖角度、张颖时间等，直接关系到水稻的异交结实率，对杂交水稻制种产量有着关键影响；穗部性状如穗长、穗粒数、千粒重等，与水稻的产量潜力密切相关。通过对武育粳3号背景的镇稻88CSSL群体进行异交性状和穗部性状QTL（QuantitativeTraitLocus，数量性状位点）检测，可以明确这些性状的遗传基础，挖掘与之紧密连锁的分子标记，为分子标记辅助选择育种提供技术支持，加速高产、优质水稻新品种的选育进程，对于保障粮食安全和促进农业可持续发展具有重要意义。

1.2国内外研究现状

在水稻染色体片段置换系构建方面，国内外学者已开展了大量研究。通过不同亲本组合和回交策略，构建了多个水稻CSSL群体，并利用这些群体对多种农艺性状进行了遗传解析。例如，中国农业科学院作物科学研究所构建了以籼稻‘9311’和粳稻‘日本晴’为受体亲本，以野生稻为供体亲本的染色体片段置换系，验证了群体在QTL定位上的高效性。然而，现有CSSL群体仍存在一些不足，如部分群体的染色体片段覆盖度不够全面，导致某些基因的挖掘受限；一些群体的遗传背景较为复杂，影响了QTL定位的准确性。

在水稻异交性状QTL检测方面，研究人员已定位到多个与柱头外露率、开颖角度等异交性状相关的QTL。这些研究为揭示异交性状的遗传机制提供了一定的理论基础，但由于异交性状受环境影响较大，且遗传机制较为复杂，目前已鉴定出的QTL在不同遗传背景和环境下的稳定性和可利用性仍有待进一步验证。

对于水稻穗部性状QTL检测，国内外学者也取得了丰硕成果，在不同水稻群体中定位到大量与穗长、穗粒数、千粒重等穗部性状相关的QTL。然而，穗部性状是由多基因控制的复杂数量性状，各QTL之间存在相互作用，且环境因素对其表达影响显著，导致目前对穗部性状的遗传调控网络认识还不够深入，许多重要QTL的功能尚未明确，限制了其在水稻育种中的有效应用。

1.3研究目标与内容

本研究旨在构建武育粳3号背景的镇稻88CSSL群体，并对该群体的异交性状和穗部性状进行QTL检测，具体研究内容如下：

亲本选择与杂交：选用高产、中早、耐病的武育粳3号作为母本，具有耐盐碱性、耐草害性、耐低温性等优良性状的镇稻88为父本，进行杂交，获得F1代种子。

群体构建：将F1代与武育粳3号进行多代回交，并结合分子标记辅助选择，筛选出含有镇稻88染色体片段的单株，自交纯合后构建武育粳3号背景的镇稻88CSSL群体。

异交性状鉴定与测定：对CSSL群体及亲本进行异交性状调查，包括柱头外露率、开颖角度、张颖时间、花粉活力等，采用田间观测和室内测定相结合的方法，获取准确的表型数据。

穗部性状鉴定与测定：在水稻成熟后，对CSSL群体及亲本的穗部性状进行测定，如穗长、穗粒数、一次枝梗数、二次枝梗数、千粒重等，分析穗部性状的遗传变异。

QTL检测：提取CSSL群体及亲本的DNA，利用SSR、SNP等分子标记进行基因分型，构建遗传连锁图谱。采用复合区间作图法等QTL分析方法，对异交性状和穗部性状进行QTL定位，确定相关QTL在染色体上的位置、效应及遗传贡献率。

1.4研究方法与技术路线

杂交与回交：按照常规水稻杂交