2025年大学《生物信息学》专业题库—— 生物信息学在疫病预防中的应用.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——生物信息学在疫病预防中的应用

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、简答题

1.简述高通量测序技术在获取疫病病原体基因组信息中的主要优势及其在病毒溯源中的应用原理。

2.描述利用生物信息学方法进行疫病暴发早期预警的主要流程，并列举至少三种关键的生物信息学分析技术。

3.解释什么是系统发育树，并说明其在区分不同疫病流行株、追踪传播路径方面的作用。

4.简述生物信息学在疫苗设计和开发过程中可能涉及的关键步骤和技术。

5.描述生物信息学方法如何用于评估一种新开发的疫病诊断试剂（如核酸检测kit）的性能指标，如灵敏度与特异性。

二、计算与分析题

1.假设你获得了一组来自同一疫病爆发区域的不同样本的病毒基因片段序列。请设计一个简化的生物信息学分析流程，用于初步判断这些样本是否属于同一变异株，并简述在该流程中可能使用的关键工具或算法及其作用。

2.某研究团队收集了某城市过去一年每月的流感病例报告数据（病例数）和当地气候数据（如平均温度、降水量）。请提出一种利用生物信息学思维整合分析这两种数据的方法，旨在探讨气候因素是否与当地流感流行趋势存在关联，并简述分析思路。

3.在开发针对某快速传播的呼吸道疫病的mRNA疫苗时，研究人员需要预测候选抗原（mRNA序列编码的蛋白）的免疫原性。请简述生物信息学中用于预测蛋白质免疫原性的常用方法，并说明选择合适预测方法时应考虑哪些因素。

4.假设你正在分析一份来自疫病患者的基因测序数据，初步发现患者感染了某种细菌，且该细菌可能存在耐药基因。请简述你将如何利用生物信息学工具来确认这种耐药性，并推断可能的传播来源（如果信息允许）。

三、论述题

1.论述生物信息学在提升全球疫病监测网络能力方面的重要性，并分析其面临的挑战，如数据共享、标准化、计算资源等。

2.结合一个具体的疫病案例（如COVID-19），论述生物信息学在疫病诊断技术发展中的应用及其对疫情防控产生的深远影响。

3.从公共卫生决策的角度，讨论生物信息学分析结果如何为疫病的防控策略（如资源分配、疫苗接种计划）提供科学依据，并探讨如何平衡数据利用效率与个人隐私保护。

试卷答案

一、简答题

1.答案：高通量测序技术能够快速、低成本地获取疫病病原体的大量基因组序列数据。其主要优势包括：测序通量高、覆盖度广、能够发现低丰度序列、对复杂群落有较好的解析能力。在病毒溯源中，通过将样本病毒基因组序列与已知数据库进行比对，可以确定病毒种类、发现新的变异株；通过构建系统发育树等进化分析，可以将样本序列与不同地区、不同时间的序列进行关联，从而追踪病毒的地理来源、传播路径和进化历史。

解析思路：考察对高通量测序技术基本原理、优势以及其在病毒溯源中具体应用方法的理解。需要回答技术优势是什么，以及这些优势如何支持溯源工作，具体通过哪些分析手段（序列比对、系统发育分析）来实现溯源。

2.答案：利用生物信息学方法进行疫病暴发早期预警的主要流程包括：实时收集和整合多源数据（如临床诊断数据、实验室检测数据、航班乘客信息、社交媒体信息、环境监测数据等），利用数据清洗和预处理技术进行数据标准化和质量控制，应用统计分析、机器学习等方法检测数据中的异常模式或趋势（如病例数的快速上升、新变异株的出现），建立预警模型并设定阈值，当监测指标超过阈值时触发警报。关键生物信息学分析技术包括：时空聚类分析、异常检测算法、序列比对与变异检测、网络分析等。

解析思路：考察对早期预警系统流程的掌握，需要概述数据来源、处理方法、分析技术和最终目标。强调生物信息学在数据处理、模式识别和模型构建中的核心作用。

3.答案：系统发育树是一种树状图，表示不同生物实体（如病毒株）之间的进化关系，通常以共同祖先为根，以分支的长度（可能代表时间或遗传距离）表示亲缘关系的远近。通过比较不同疫病流行株的基因组或蛋白质序列，可以构建系统发育树。系统发育树能够直观展示各流行株之间的亲缘关系，帮助区分不同传播链或暴发源，识别可能的传播路径，追踪病毒变异和扩散的时空动态，为制定防控策略提供依据。

解析思路：考察对系统发育树概念、构建方法和应用价值的理解。需要解释树的结构含义，并说明如何利用树状图的信息来分析流行病学问题。

4.答案：生物信息学在疫苗设计和开发中涉及的关键步骤和技术包括：利用高通量测序技术获取目标病原体的完整基因组或关键蛋白序列；通过序列比对、系统发育分析等方法，识别保守抗原表位和免疫优势表位；利用生物信息学工具（如B细胞和T细胞受体结合预测、分子动力学模拟）进行抗原表位预测和优化；设计表达载体（如mRNA序列设计、病毒载体包膜