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生存分析
牛晨光
第一临床学院
如何评价慢性病和难以治愈的恶性肿瘤患者治疗后的
结局指标?
生存率?生存时间?
课程内容
1.基本概念
2.生存率的描述
3.生存曲线的假设检验
4.Cox比例风险回归
生存分析基本概念
患者编号
性别
年龄
确诊时间(月)
手术日期
终访日期
结局
生存时间(月)
1
男
32
10
1994.01.23
1994.12.14
死亡
11
2
女
48
12
1998.02.14
1999.01.01
失访
10+
3
女
26
6
1992.03.04
1995.04.12
死亡
37
4
男
55
3
1999.08.20
2001.09.21
死于其它
25+
5
女
58
8
2001.03.10
2001.12.31
存活
9+
…
…
…
…
…
…
…
…
364
男
46
12
2000.08.12
2001.12.12
存活
16+
案例分析
某医师收集了1992年1月1日到2001年12月31日10年间共346例手术后的大肠癌患者资料,以了解患者术后生存情况及其可能的影响因素。结果如下:
起始时间和终点事件
起始事件(initialevent)是反映研究对象生存过程的起始特征的事件。
终点事件(endpointevent)又称死亡事件、失效事件(failureevent),是指研究者所关心的特定结局。
两者相对而言,都由研究目的所决定,须在设计时就明确规定,并在研究期间严格遵守而不能随意更改。
生存时间
生存时间(survivaltime),又称失效时间(failuretime),为终点事件与起始事件之间的时间间隔,常用符号t表示。
欲得到准确的生存时间,必须明确规定起始事件与终点事件,同时还要考虑恰当的时间测量单位(小时、日、月、年等)。
删失值
在随访研究中,由于某种原因未能观察到对象发生事先定义的终点事件,无法得知随访对象的确切生存时间,这种现象称为删失或截尾(censoring)
包含删失值的数据称为不完全数据。
只知道某个体的生存时间小于L,称L为左删失数据,记为L-。
只知道某个体的生存时间大于L,称L为右删失数据,记为L+,主要原因:
。失访(失去联系、退出治疗、意外死亡)
。终止(随访结束时仍存活)
死亡概率:q=
死亡率:D(t)=
生存概率:p=
生存率:S(t)=
St=p1×p2×…×pt
观察总数
期间存活数
期初总数
期间存活数
观察总数
期间死亡数
期初总数
期间死亡数
粗(年)出生率:
某年内活产数
m=某年平均人数×1000咖
生存概率和生存率
粗(年)死亡率:
某年内死亡数m=
某年平均人数
×1000咖
生存率的描述
寿命表法
乘积限法
寿命表法
寿命表法(lifetablemethod)将原始资料按照生存时间分为不同组段得到各组段频数,然后进行生存率描述。
生存概率的计算过程中,如遇到删失值,需对期初观察人数进行校正:
校正期初观察人数=期初观察人数-删失人数/2
该法常用于大样本分组资料的生存率估计,是一种非参数方法。
Kaplan-Meier法
寿命表法只能用于大样本资料,当观察例数较少时,为充分利用每个数据所包含的信息来计算不同时间点随访对象的生存率,并进一步绘制生存曲线,就需用更为精确的方法,其中常用的一种非参数方法称为乘积限法
(product-limitmethod)。
该方法直接对所有原始数据用概率乘法原理估计生存率,由Kaplan和Meier于1958年提出,故也称Kaplan-Meier法。
主要用于小样本资料的生存率估计,也可用于大样本。
生存曲线的假设检验
近似Log-rank检验
1.H0:两种治疗方法的总体治疗方法相同。
2.合并两组数据,计算统计量:
x,服从k-1的x2分布
3.计算p值,做出推断。
精确检验方法
计算公式:
权重值:
。Log-rank(Mantel-Cox)法:wi=1
。Gehan-Breslow-Wilcoxon法:wi=ni
。Tarone-Ware法:wi=ni
v=2-1=1
v=2-1=1
v=2-1=1
注意事项
近似法计算简便,但其结果较精确法保守。
一般统计软件输出精确法计算结果。
Log-rank(Mantel-Cox)法给每个时间点数据相同的权重1,即不加权。对近期生存率差别比较敏感。
Gehan-Breslow-Wilcoxon法设置权重为各时点开始时存活的人数。对初期生存率差别比较敏感。
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