2025年生物样本库样本单细胞测序数据使用知情同意书.docxVIP

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2025年生物样本库样本单细胞测序数据使用知情同意书

一、样本与数据使用的具体内容

您此前自愿捐赠并存储于XX生物样本库(以下简称“本库”)的生物样本(包括但不限于血液、组织、细胞等)及相关临床数据(包括但不限于年龄、性别、疾病诊断、治疗史、影像学结果等),现拟用于单细胞测序技术分析及衍生数据的研究使用。具体说明如下:

(一)样本处理与测序流程

1.样本提取:本库将从已存储的生物样本中提取符合单细胞测序要求的细胞悬液,提取过程遵循《临床实验室质量控制规范》(GB/T20468-2023),确保样本活性与完整性。

2.单细胞分离:采用微流控技术或激光捕获显微切割技术分离单个细胞,设备为XX公司生产的单细胞分选系统(型号:XXX),分离过程经质量控制,确保单细胞捕获率≥90%。

3.测序建库:对分离的单细胞进行全基因组或转录组扩增,使用IlluminaNovaSeq6000测序平台进行高通量测序,测序深度为每个细胞50,000-100,000条reads,确保数据覆盖度。

4.数据处理:原始测序数据经碱基校正(使用FastQC软件)、比对(使用STAR软件比对至人类参考基因组GRCh38)、表达量计算(使用Salmon软件)等步骤,生成单细胞表达矩阵及细胞亚群聚类结果。

(二)数据衍生与应用方向

通过单细胞测序获得的数据(包括原始测序数据、分析后的表达矩阵、细胞亚群标记基因列表等)将用于以下研究:

1.疾病机制研究:分析特定疾病(如肺癌、阿尔茨海默病)不同细胞亚群的基因表达差异,探索疾病发生发展的关键细胞类型及分子通路;

2.生物标志物开发:筛选与疾病早期诊断、疗效评估或预后相关的单细胞水平生物标志物(如特定细胞亚群比例、特征基因表达量);

3.药物靶点验证:通过分析药物处理前后细胞亚群的动态变化,验证候选药物靶点的有效性及作用机制;

4.公共数据库共享:经去标识化处理后,部分数据将提交至国家人类遗传资源共享服务平台(NHGRS)或国际认可的单细胞数据库(如HumanCellAtlas),用于推动全球生命科学研究合作。

二、样本与数据的使用范围与期限

(一)使用主体

本库将作为样本与数据的管理主体,具体研究由本库与合作单位(包括但不限于XX医科大学、XX医院、XX生物医药研究院)共同实施。合作单位需签署《生物样本与数据使用协议》,承诺仅用于约定的研究目的,严格遵守隐私保护条款。

(二)使用范围限制

所有样本与数据的使用仅限于科学研究,不用于以下用途:

-商业盈利(如直接出售样本或数据、用于化妆品或保健品开发等);

-个人身份识别(除非法律强制要求且经伦理委员会批准);

-非医学目的的基因编辑或生殖干预。

(三)存储与使用期限

1.样本存储:已用于单细胞测序的剩余样本(如未使用的细胞悬液、DNA/RNA提取物)将继续存储于本库-80℃低温冰箱或液氮罐中,存储期限为本研究结束后15年(研究预计于2030年12月31日结束),或至相关法律法规要求的最长存储期限(以较长期限为准)。

2.数据存储:原始测序数据存储于本库加密服务器(存储位置:XX市XX区XX路XX号XX大厦B座3层),分析后数据存储于国家生物信息中心(北京)的安全云平台,存储期限与样本一致。

三、隐私保护措施

本库承诺严格保护您的个人信息与数据隐私,具体措施如下:

(一)去标识化处理

所有样本与数据在使用前将进行去标识化处理,包括:

-移除直接标识符(如姓名、身份证号、联系方式、住院号);

-替换间接标识符(如将“XX医院2023年5月入院的65岁男性肺癌患者”替换为“样本编号S202305001,年龄65±5岁,性别男,疾病类型肺癌”);

-采用哈希算法对剩余可能关联个人的信息(如特定病史组合)进行脱敏,确保通过常规技术手段无法追溯至您本人。

(二)访问控制

1.数据访问仅允许经伦理委员会审批的研究人员操作,需通过多因素认证(用户名+密码+动态验证码)登录系统;

2.研究人员仅能访问与其研究任务相关的最小数据集合(如仅需某类细胞亚群的表达量数据时,无法获取原始测序读长);

3.所有访问行为将被记录(包括访问时间、操作内容、退出时间),日志保存期限为数据存储期限届满后5年。

(三)第三方共享管理

数据若需共享至本库及合作单位以外的第三方(如国际数据库),需满足以下条件:

-经本库伦理委员会(伦理批号:XX-2025-001)审查通过;

-第三方签署《数据保密协议》,承诺仅用于约定的研究目的,不进行再共享;

-共享数据为二次去标识化版本(即在本库去标识化基础上,进一步模

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