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遗传育种与繁殖
引用本文格式姜建萍,夏祥华,李林轩,等.参环毛蚓的全长转录组测序及环境适应性相关基因分析[J].现代畜牧科技,2025,
53(5):52-56.doi:10.19369/j.cnki.2095-9737.2025.05.016.JIANGJianping,XIAXianghua,LILinxuan,etal.Full-length
TranscriptomeSequencingandAnalysisofGenesRelatedtoEnvironmentalAdaptionofPheretimaAspergillum[J].ModernAnimalHusbandry
ScienceTechnology,2025,53(5):52-56.
参环毛蚓的全长转录组测序及环境适应性相关基因分析
**
姜建萍,夏祥华,李林轩,张慧杰,谭舒丹,邹辉,霍娟,黄媛,赵成坚,徐永莉,闫志刚,张占江
(广西壮族自治区药用植物园,广西道地药材高品质形成与应用重点实验室,广西药用动物标准化养殖重点
研究室,广西南宁530023)
摘要:为获得参环毛蚓的转录本信息和功能基因,基于PacBio平台的SMRT对参环毛蚓的受精囊、精巢、肌肉、盲肠和前
列腺等组织进行三代全长转录组测序。通过质控获得12934条高质量isoform(平均长度为2034bp,N50长度为2325bp)。
使用NR等数据库进行功能注释,共有10110(79%)条isoform得到注释。获得参环毛蚓全长转录组本序列,鉴定出环境适
应相关基因及通路,为解析其复杂生境适应分子机制提供数据支撑。
关键词:参环毛蚓;全长转录组;功能注释;信号通路;环境适应性
中图分类号:S899文献标识码:Adoi:10.19369/j.cnki.2095-9737.2025.05.016
Full-lengthTranscriptomeSequencingandAnalysisofGenesRelatedtoEnvironmental
AdaptionofPheretimaAspergillum
JIANGJianping,XIAXianghua,LILinxuan,ZHANGHuijie,TANShudan,ZOUHui,HUOJuan,
**
HUANGYuan,ZHAOChengjian,XUYongli,YANZhigang,ZHANGZhanjiang
(GuangxiKeyLaboratoryofStandardizedBreedingofMedicinalAnimals,GuangxiKeyLaboratoryofHigh-Quality
FormationandUtilizationofDao-diHerbs,GuangxiBotanicalGardenofMedicinalPlants,NanningGuangxi530023,China)
Abstract:ToobtaintheabundanttranscriptinformationandfunctionalgenesofPheretimaaspergillum.Full-lengthtranscriptome
sequencingforseminalvesicle,testis,muscle,cecumandprostateglandofPheretimaaspergillumwasperformedusingSMRT
basedonthePacBioplatform.Afterqualitycontrol,atotalof1293
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