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第45卷第6期西南林业大学学报Vol.45No.6

2025年11月JOURNALOFSOUTHWESTFORESTRYUNIVERSITYNov.2025

大豆瘪荚率的遗传解析及其遗传位点的关联分析定位

耿雅婷王俊高华伟3.4杨梦园张湘李敏敏于倩倩王淑蕾刘立科

4.中国农业科学院南繁研究所（三亚），海南三亚572024；5.河南合健生物医学研究院有限公司，河南焦作454000；

6.中国国家知识产权局太原代表处，山西太原030006；7.聊城市农业科学院，山东聊城252000）

摘要：对1554份大豆种质3年的瘪荚率（FPR）进行了鉴定，并利用全基因组关联分析（GWAS）

对控制瘪荚的相关遗传位点进行了定位，探讨其发生规律及遗传基础。结果表明：环境（年份）、

基因型及其相互作用对FPR均有显著影响。FPR范围为0.00%~70.30%，平均为4.30%，FPR5.34%

的大豆种质占75%，FPR10%的占94.5%。最终筛选出6个FPR为0.00%的优异种质。利用方差

分析方法，估计出FPR的广义遗传力为0.51。FPR与大豆的驯化和改良性状有关，地方品种的

FPR通常低于改良品种。GWAS定位到6个与FPR相关的OTL位点，分布在5条染色体上。其

中，第18号染色体上的qFPR-3位点可以用2种GWAS分析方法同时检测到。根据qFPR-3定位

区间内基因的单倍型分析结果和基因注释信息，筛选出编码五肽重复（PPR）超家族蛋白的

Glyma.18G085900基因作为qFPR-3位点的候选基因。

关键词：大豆；瘪荚率；广义遗传；全基因组；关联分析

中图分类号：S565.1文献标志码：A文章编号：2095-1914（2025）06-0098-10

引文格式：耿雅婷，王俊，高华伟，等.大豆瘪荚率的遗传解析及其遗传位点的关联分析定位[J].西南林业大学

学报（自然科学),2025,45(6):98-107.GengYT,WangJ

SoybeanandMappingAssociatedGeneticLoci[J].JournalofSouthwestForestryUniversity,2025,45(6):98-107.

DOI:10.11929/j.swfu.202502034

GeneticDecipheringofFlatPodRateinSoybeanandMapping

AssociatedGeneticLoci

GengYating1,WangJun²,GaoHuawei3.4,YangMengyuan5,ZhangXiang6,LiMinmin7,

YuQianqian,WangShulei,LiuLike1

(1.CollegeofAgricultureandBiology,LiaochengUniversity,LiaochengShandong252000,China;2.TheShennongLaboratory,ZhengzhouHenan

450002,China;3.InstituteofCropSciences,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100081,China;4.NationalNanfanResearchInsti-

tute(Sanya),ChineseAcademyofAgriculturalSciences,SanyaHainan572024,China;5.HenanJoincareBiomedicalResearchInstituteCo.,Ltd.

JiaozuoHenan454000,China