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- 2026-01-09 发布于江西
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陈秀银,谢星朋,陈美君,等.贝莱斯芽孢杆菌BE14-1的全基因测序及产细菌素基因分析[J].中兽医医药杂志,2025,44(1):9-17
DOI:10.13823/ki.jtcvm.2024.097中图分类号:S853.7文献标识码:A文章编号:1000-6354(2025)02-0009-09
贝莱斯芽孢杆菌BE14-1的全基因测序及产细菌素基因分析
陈秀银,谢星朋,陈美君,黄瑾,黄瑞敏,黄琪欣,马浩天,彭金菊
(广东海洋大学滨海农业学院动物医学系,广东湛江524000)
摘要:贝莱斯芽孢杆菌(Bacillusvelezensis)BE14-1是从红树林植物中分离的具有良好抗菌活性的
芽孢杆菌。本试验旨在探究贝莱斯芽孢杆菌BE14-1的抗菌机理,并对全基因组序列进行分析,以期挖
掘BE14-1的抗菌等功能特性基因。通过固体琼脂打孔法测定贝莱斯芽孢杆菌BE14-1的无细胞上清液
的抑菌活性,并探讨木瓜蛋白酶对BE14-1抑菌效果的影响;基于MGIDNBSEQ-T7平台对贝莱斯芽孢杆
菌BE14-1进行全基因组测序分析,通过序列组装、基因预测和功能注释以及antiSMASH和BAGEL4在
线数据库挖掘潜在的细菌素基因簇及潜在的作用机制,分析BE14-1产生细菌素的潜能。结果显示,贝莱
斯芽孢杆菌BE14-1的无细胞上清液对铜绿假单胞菌、产气肠杆菌、多杀性巴氏杆菌和粪肠球菌均具有良
好的抑菌效果;经木瓜蛋白酶处理后,无细胞上清液对4种指示菌的抑菌效果均显著下降;全基因组测
序显示,贝莱斯芽孢杆菌BE14-1的基因组大小为3954070bp,GC含量为46.29%。共预测到4035个
蛋白质编码基因、10个rRNA、81个tRNA;基因组中含有18个与抗氧化活性相关的基因,以及6个与调控
免疫和炎症信号通路相关的基因;预测贝莱斯芽孢杆菌BE14-1存在5个相关细菌素合成基因簇,分别为
T3PKS、lanthipeptideclassⅡ、lanthipeptideclassⅤ、amylocyclicin和LCI。以上提示,贝莱斯芽孢杆菌
BE14-1是一种潜在的产细菌素菌株,本试验结果可为进一步研究BE14-1的抗菌特性提供理论基础。
关键词:芽孢杆菌;全基因组测序;基因功能注释;细菌素
细菌耐药性问题日益凸显,不断威胁人类与畜禽测其功能[15-16]。本研究以从红树林植物中分离的1株
健康。抗微生物药物耐药性已成为全球公共卫生危具有良好抑菌活性的贝莱斯芽孢杆菌BE14-1为研究
害,人类健康、畜牧兽医以及环境安全等领域均受到对象,对其发酵上清液进行抑菌活性检测,并对菌株
[1-2]
耐药细菌的威胁。大肠杆菌、铜绿假单胞菌、多杀进行全基因组测序,结合直系同源集(Clustersof
性巴氏杆菌、粪肠球菌等多种细菌的耐药现象不断被OrthologousGroups,COG)、基因本体论(GeneOntology,
[3-9]
发现。因此,寻找替抗药物势在必行。红树林作GO)、京都基因与基因组百科全书(KyotoEncyclopedia
为海陆交界的特殊生态系统,兼具海陆两性及高盐、ofGenesandGenomes,KEGG)等详细地解析基因组信
沼泽化、低氧等环境特点,蕴藏着丰富多样的微生物息,并通过antiSMASH和BAGEL4在线数据库预测潜
群落,微生物为适应复杂的环境,可产生特殊的活性在细菌素,旨在为开发贝莱斯芽孢杆菌BE14-1提供
物质[10-12]。芽孢杆菌是一类可以产生芽孢的革兰阳生物信息基础。
性菌,可以产生不同的具有抗菌活性的代谢物,包括1材料与方法
细菌素和脂肽等,对不同细菌均具有良好的抑菌效1.1材料
果[13-14]。如今,越来越多的研究人员通过利用全基因贝莱斯芽孢杆菌BE14-1由广东海洋大学滨海农
测序技术挖掘不同芽孢杆菌菌株的基因组信息,并预业学院动物医学实验室从
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