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第45卷第6期高师理科学刊Vol.45No.6

2025年6月JournalofScienceofTeachers′CollegeandUniversityJun.2025

文章编号:1007-9831(2025)06-0066-09

辣椒素不同积累期circRNA的测序及功能分析

1,21,231,2

冯嘉馨,吴鹏,刘志洋,郭茜茜

(齐齐哈尔大学1.生命科学与农林学院,2.抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室,黑龙江齐齐哈尔161006;

3.哈尔滨市农业科学院,黑龙江哈尔滨150028)

摘要:以“京椒一号”辣椒胎座为实验材料,通过RNA-Seq技术在辣椒素积累期起点(C1)、

峰值(C2)和终点(C3)构建辣椒circRNA数据库,筛选差异表达circRNA基因并进行功能富

集分析,以期探究circRNA的表达特征及其对辣椒素合成的调控机制。结果表明,共构建出9

个样本文库,得到868210724个有效读数,数据可靠,满足后续分析。利用高通量测序共获得

1179个circRNA,其中有58.52%来源于外显子区域。在成对比较C1_vs_C3,C2_vs_C1,C2_vs_C3

组间,分别筛选出46,38,30个差异表达circRNA。GO富集分析表明,差异表达circRNA来

源基因主要涉及细胞过程、代谢过程和催化活性等功能类别。KEGG富集结果表明,差异表达

circRNA来源基因参与色氨酸代谢、赖氨酸降解和丙酸代谢等代谢途径。GO富集分析和KEGG

富集结果表明,差异表达circRNA的来源基因主要与调节前体物质的供应、催化关键步骤及维

持合成途径的细胞环境相关,为后续挖掘辣椒素合成的关键基因提供参考。

关键词:辣椒;circRNA;转录组;差异表达基因

中图分类号:Q7文献标识码:Adoi:10.3969/j.issn.1007-9831.2025.06.012

SequencingandfunctionalanalysisofcircRNAsatdifferent

accumulationstagesofcapsaicin

1,21,231,2

FENGJiaxin,WUPeng,LIUZhiyang,GUOQianqian

(1.SchoolofLifeSciences,AgricultureandForestry,2.HeilongjiangProvincialKeyLaboratoryofResistanceGeneEngineeringandProtectionof

BiodiversityinColdAreas,QiqiharUniversity,Qiqihar161006,China;3.HarbinAcademyofAgriculturalSciences,Harbin150028

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