浙江省水稻种质资源的遗传相似度分析.pdfVIP

植物遗传资源学报2025，26（9）：1734-1743

JournalofPlantGeneticResourcesDOI：10.13430/ki.jpgr.20250211001

浙江省水稻种质资源的遗传相似度分析

1，31，3221111，31

严志琴，章孟臣，陈小央，李燕，徐群，王珊，冯跃，魏兴华，杨窑龙

12

（中国水稻研究所/水稻生物育种全国重点实验室，杭州311400；浙江省种子管理总站，杭州310000；

3中国农业科学院国家南繁研究院，海南三亚572024）

摘要：浙江省水稻栽培历史悠久，拥有丰富的稻种资源。目前保存在国家水稻种质资源中期库（杭州）的浙江省稻种资源

共有2000余份，但并没有进行系统的筛选鉴定，导致一些稻种资源重复保存。以1970份浙江省原产稻种资源为研究材料，利

用第二代重测序技术构建了浙江省稻种资源的基因组变异图谱，通过测序深度、连锁不平衡、缺失率等条件对SNP进行过滤，

筛选10532个核心SNP标记用于遗传相似度计算。对13组主要的同名品种进行分析，同名品种之间的遗传相似度均未超过

0.95，且相互之间存在较大的表型变异，因此同名材料间实际为不同的水稻品种。同时利用1970份材料的核心SNP标记，通

过计算两两遗传相似度，筛选出11个高遗传相似度的材料组合。比较表型鉴定结果、植株形态特征发现，高遗传相似度的材

料具有高度相似的表型与田间表现，在一定程度上证实了遗传相似度在水稻品种鉴定中的有效性。本研究基本摸清了浙江省

水稻种质资源保存现状，揭示了同名品种不一定为重复品种，而异名品种也可能属于同一品种，为浙江省水稻种质资源的保护

和利用提供了重要的科学依据。

关键词：稻种资源；核心SNP标记；遗传相似度；表型变异

GeneticSimilarityAnalysisofRiceGermplasmResourcesin

ZhejiangProvince

1，31，3221

YANZhiqin，ZHANGMengchen，CHENXiaoyang，LIYan，XUQun，

111，31

WANGShan，FENGYue，WEIXinghua，YANGYaolong

1

（ChinaNationalRiceResearchInstitute/StateKeyLaboratoryofRiceBiologyandBreeding，Hangzhou311400；

23

ZhejiangProvincialDepartmentofAgricultureSeedManagementStation，Hangzhou310000；NationalNanfan