CN110760599A 大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用 （吉林省水产科学研究院）.docxVIP

(19)中华人民共和国国家知识产权局

(12)发明专利申请

(10)申请公布号CN110760599A

(43)申请公布日2020.02.07

(21)申请号201911295159.X

(22)申请日2019.12.16

(71)申请人吉林省水产科学研究院

地址130033吉林省长春市二道区昆山路

1195号

(72)发明人郑伟韩叶闫春梅万继武

李忠强马驰刘慧吉王战蔚

(74)专利代理机构青岛海昊知识产权事务所有限公司37201

代理人刘艳青

(51)Int.CI.

C12Q1/6888(2018.01)

C12N15/11(2006.01)

权利要求书1页说明书7页序列表6页附图1页

(54)发明名称

大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用

(57)摘要

CN110760599A本发明公开了大麻哈鱼的微卫星分子标记位点及多态性引物和应用。本发明从大麻哈鱼基因组DNA中筛选出10个微卫星位点，并根据这些位点在微卫星位点两端的侧翼序列设计特异性引物，使用所获得引物的扩增结果具有多态性和

CN110760599A

CN110760599A权利要求书1/1页

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1.大麻哈鱼微卫星分子标记位点的序列，其特征在于，该序列为SEQID:1-10。

2.如权利要求1所述微卫星分子标记位点序列，其特征在于，该微卫星分子标记位点两端的侧翼序列上设计的引物序列为SEQID:11-30。

3.权利要求2所述的引物序列SEQID:11-30的筛选方法，其特征在于，该筛选方法基于全基因组的简化基因组测序后进行多态性筛选。

4.如权利要求3所述的筛选方法，其特征在于，所述筛选方法具体为：先用酶切法建库，然后进行测序，对读到的序列进行微卫星分析，先选出微卫星重复单元比较多的序列，再对比基因组文库筛选得到了多个微卫星分子标记位点，并根据相关位点，设计引物并予以合成；再在大麻哈鱼多个个体中进行PCR扩增验证，筛选出扩增产物正确的引物对，再对产物正确的引物对进行筛选，最终从中筛选出10对多态性良好的微卫星引物序列SEQID:11-

30。

5.权利要求1所述的微卫星分子标记位点序列SEQID:1-10在大麻哈鱼亲缘鉴定中的

应用。

6.权利要求2所述的引物序列SEQID:11-30在大麻哈鱼亲缘鉴定中的应用。

7.如权利要求7所述的应用，其特征在于，该应用的具体亲缘鉴定方法包括以下步骤：

1)样品基因组DNA提取；

2)荧光引物合成：对得到的10对引物序列SEQID:11-30进行荧光引物合成；

3)PCR扩增，产物分析检测；

4)对上述检测数据分析，计算等位基因、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量，多态性分析鉴定亲缘关系。

CN110760599A说明书1/7页

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大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用

技术领域

[0001]本发明属于分子生物学DNA分子标记技术领域，具体涉及大麻哈鱼微卫星分子标记的开发技术。

背景技术

[0002]大麻哈鱼Oncorhynchusketa(Walbaum)隶属鲑科太平洋鲑属，具溯河洄游性，即为江里生、海里长又回原产地河流产卵繁殖。大麻哈鱼系世界名贵经济鱼类，其卵也是著名的水产品，营养价值很高，素以肉质鲜美、营养丰富著称于世，历来被人们视为名贵鱼类。大麻哈鱼也是吉林省长白山地区图们江流域著名的冷水性鱼类。但是，由于近些年其生存环境恶化，致使其资源急剧减少，目前已处于濒危状态，亟需大力开展水产种质资源保护工作。水产资源作为农林水中的重要组成部分，抵御环境胁迫的能力最弱，因农、林、水利的不利影响导致水生生物灭绝的事例越来越多，且一经灭绝无法修复，因此保护大麻哈鱼等鱼类资源势在必行，有条件的国家也都采取人工增殖放流措施，并将此作为分配海洋捕捞份额的依据，而开展大麻哈鱼人工增殖放流属地的追踪调查研究是其中最首要的一环。

[0003]即，如何建立微卫星分子标记方法鉴定亲子关系，有效地追踪大麻哈鱼人工增殖放流属地是当前亟需解决的问题。

发明内容

[0004]本发明的目的是提供大麻哈鱼微卫星分子标记位点以及其多态性引物，并提供具体的应用方法，以弥补现