基于重测序的开农系列花生品种(系)遗传多样性分析.pdfVIP

山东农业科学２０２５ꎬ５７(４):５１~５８ＳｈａｎｄｏｎｇＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ

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ＤＯＩ:１０.１４０８３/ｊ.ｉｓｓｎ.１００１４９４２.２０２５.０４.００７

基于重测序的开农系列花生品种(系)

遗传多样性分析

１１１２１３３１

郭敏杰ꎬ邓丽ꎬ苗建利ꎬ雒峰ꎬ殷君华ꎬ孙宜根ꎬ肖婷ꎬ任丽

(１.开封市农林科学研究院ꎬ河南开封４７５００４ꎻ２.河南省种业发展中心ꎬ河南郑州４５００００ꎻ

３.开封市种业发展中心ꎬ河南开封４７５００４)

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摘要:本研究以０３１７组合(开农３０开选０１６)衍生的且推广面积较大的３０份开农系列花生品种(系)为

材料ꎬ基于二代全基因组重测序数据开展品种(系)间遗传相似性分析、群体结构分析和聚类分析ꎬ以为我国

花生种质资源高效利用提供基础材料和可视化的技术参考ꎮ结果表明ꎬ质控后获得４２３１４９个在染色体上分

布均匀的高质量单核苷酸多态性(ＳＮＰ)位点ꎬ其中３号染色体上的ＳＮＰ位点最多ꎬ１０号染色体上的最少ꎬ分

别占总数的８.５６％和２.６６％ꎮ不同花生品种(系)间存在４３５个遗传相似性系数值ꎬ取值范围为０.５５~０.９６ꎬ平

均值为０.７３ꎻ开农３０１和开农３０６的遗传相似性系数最高(０.９６)ꎬ遗传关系最近ꎻ开农１７６和开农１００的遗传

相似性系数最低(０.５５)ꎬ遗传关系最远ꎮ群体结构分析将３０份花生品种(系)分为３个亚群ꎬ分别占总数的

３０.００％、３３.３３％和３６.６７％ꎬ其中开农９９和开农６５的遗传背景相对复杂ꎮ聚类分析结果得出ꎬ３０份花生品种

(系)的群体遗传热图与进化树结果相吻合ꎬ３０份花生品种(系)被划分为３个类群ꎬ结合系谱关系可知ꎬ同一

组合育成品种(系)不一定聚在一起ꎮ综上ꎬ本研究中的３０份花生品种(系)的遗传相似性较高ꎬ需拓宽遗传

基础ꎻ花生优良品种选育过程中ꎬ可综合分析系谱和基于ＳＮＰ的聚类分析结果进行种质资源筛选ꎮ

关键词:花生ꎻ种质资源ꎻ０３１７组合ꎻ单核苷酸多态性ꎻ遗传多样性

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中图分类号:Ｓ５６５.２文献标识号:Ａ文章编号:１００１４９４２(２０２５)０４００５１０８

ＧｅｎｅｔｉｃＤｉｖｅｒｓｉｔｙＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＫａｉｎｏｎｇＳｅｒｉｅｓＰｅａｎｕｔ

Ｖａｒｉｅｔｉｅｓ(Ｌｉｎｅｓ)ＢａｓｅｄｏｎＷｈｏｌｅ￣ＧｅｎｏｍｅＲｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ

１１１２１３３１

ＧｕｏＭｉｎｊｉｅꎬＤｅｎｇＬｉꎬＭｉａｏＪｉａｎｌｉꎬＬｕｏＦｅｎｇꎬＹｉｎＪｕｎｈｕａꎬＳｕｎＹｉｇｅｎꎬＸｉａｏＴｉｎｇꎬＲｅｎＬｉ

(１.ＫａｉｆｅｎｇＲｅｓｅａｒｃｈＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅａｎｄＦｏｒｅｓｔｒｙꎬＫａｉｆｅｎｇ４７５００４ꎬＣｈｉｎａꎻ

２.ＨｅｎａｎＰｒｏｖｉｎｃｉａｌＳｅｅｄＩｎｄｕｓｔｒｙＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔＣｅｎｔｅｒꎬＺｈｅｎｇｚｈｏｕ４５００００ꎬＣｈｉｎａꎻ

３.ＫａｉｆｅｎｇＭｕｎｉｃｉｐａｌＳｅｅｄＩｎｄｕｓｔｒｙＤｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔＣｅｎｔｅｒ