南酸枣转录组特征分析及SSR标记开发.pdfVIP

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Ａｐｒ.２０２５ꎬ４５(４):６４１６５３

ＤＯＩ:１０.１１９３１/ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２４０６０２２

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徐梦阳ꎬ蔡宇宇ꎬ李婷ꎬ等ꎬ２０２５.南酸枣转录组特征分析及ＳＳＲ标记开发[Ｊ].广西植物ꎬ４５(４):６４１６５３.

ＸＵＭＹꎬＣＡＩＹＹꎬＬＩＴꎬｅｔａｌ.ꎬ２０２５.ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓａｎｄＳＳＲｍａｒｋｅｒｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆＣｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓ

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ａｘｉｌｌａｒｉｓ[Ｊ].Ｇｕｉｈａｉａꎬ４５(４):６４１６５３.

南酸枣转录组特征分析及ＳＳＲ标记开发

１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２∗

徐梦阳ꎬ蔡宇宇ꎬ李婷ꎬ吴南生ꎬ孙荣喜

(１.江西农业大学林学院南酸枣研究所ꎬ南昌３３００４５ꎻ２.江西农业大学林学院

亚热带森林资源培育江西省重点实验室ꎬ南昌３３００４５)

摘要:通过对南酸枣(Ｃｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓａｘｉｌｌａｒｉｓ)雌雄转录组特征进行分析及ＳＳＲ标记开发ꎬ为其遗传评价和

性别分子辅助育种提供理论支撑和科学依据ꎮ该文主要分析南酸枣雌雄转录组表达差异ꎬＳＳＲ位点的分布

及序列特征ꎬ在此基础上开展ＳＳＲ位点挖掘ꎬ并进行ＳＳＲ引物的开发和有效性验证ꎮ结果表明:(１)南酸枣

转录组测序共获得４０３４１条Ｕｎｉｇｅｎｅｓ序列ꎬ总长度、Ｎ５０长度、平均长度和ＧＣ含量分别为５２８０６３６９ｂｐ、

２４０９ｂｐ、１３０９ｂｐ和３８.７５％ꎻ共筛选到１９４９个雌雄差异表达基因ꎬ其中雄株比雌株显著上调的基因有

１０５２个ꎬ下调的基因有８９７个ꎮ(２)在所有Ｕｎｉｇｅｎｅｓ中共检测到５２５１个ＳＳＲ位点ꎬ６１９条Ｕｎｉｇｅｎｅｓ序列中

含有２个及２个以上位点ꎬＳＳＲ发生频率为１１.１８％ꎬ平均分布距离为１０.０６ｋｂꎻ在所有ＳＳＲ位点中ꎬ二核苷

酸重复所占比例最高(４６.９５％)ꎬ其次为三核苷酸重复(３４.２７％)ꎮ(３)经筛选及有效性验证共得到２０对

ＳＳＲ多态性引物ꎬ在８５份资源中共检测到８０个等位基因ꎬ平均多态性信息含量(ＰＩＣ)为０.５６ꎮ综上认为ꎬ

南酸枣叶片转录组测序质量较高ꎬ组装效果较好ꎮ２０对多态性引物为后期遗传评价、性别辅助育种及指纹

图谱构建提供参考ꎮ

关键词:南酸枣ꎬ引物开发ꎬ转录组ꎬＳＳＲꎬ位点特征

中图分类号:Ｑ９４３文献标识码:Ａ文章编号:１０００￣３１４２(２０２５)０４￣０６４１￣１３

ＴｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓａｎｄＳＳＲｍａｒｋｅｒ

ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｏｆＣｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓａｘｉｌｌａｒｉｓ

１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２∗

ＸＵＭｅｎｇｙａｎｇꎬＣＡＩＹｕｙｕꎬＬＩＴｉｎｇꎬＷＵＮａｎｓｈｅｎｇꎬＳＵＮＲｏｎｇｘｉ

(１.ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＣｈｏｅｒｏｓｐｏｎｄｉａｓａｘｉｌｌａｒｉｓＲｅｓｅａｒｃｈꎬＣｏｌｌｅｇｅｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙꎬＪｉａｎｇｘｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖ