基于生物信息学分析炎性肠病差异基因表达及ceRNA调控网络.pdfVIP

河北医药２０２５年４月第４７卷第４期ＨｅｂｅｉＭｅｄｉｃａｌＪｏｕｒｎａｌꎬ２０２５ꎬＶｏｌ４７ＡｐｒＮｏ４５３３

－论著

ｄｏｉ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１００２７３８６.２０２５.０４.００１

基于生物信息学分析炎性肠病差异基因表达及

ｃｅＲＮＡ调控网络

郝帅贺娜冯巩张粉娜杨永勤

【摘要】目的炎症性肠病(ｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙｂｏｗｅｌｄｉｓｅａｓｅꎬＩＢＤ)是一种慢性肠道炎症性疾病ꎬ因其发病机制复杂、

病因不明等因素ꎬ严重影响患者的生活质量ꎮ竞争性内源性ＲＮＡ(ｃｅＲＮＡ)在免疫调节中具有重要作用ꎬ构建１个

ｃｅＲＮＡ免疫调节网络ꎬ探讨其在ＩＢＤ机制研究、临床诊断和治疗中的潜在作用ꎮ方法检索ＧＥＯ数据库与ＩＢＤ相关

的数据集ＧＳＥ５９０７１、ＧＳＥ３６８０７和ＧＳＥ７５２１４ꎬ使用Ｒ语言分析差异表达基因(ＤＥＧｓ)ꎬ并通过ｓｔａｒＢａｓｅ数据库、

ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ数据库和ｍｉＲＤＢ数据库预测ＤＥＧｓ的ｍｉＲＮＡꎬＬｎｃＲＮＡＤｉｓｅａｓｅ数据库预测ＩＢＤ相关的ｌｎｃＲＮＡꎬ使用

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Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ软件构建ｌｎｃＲＮＡｍｉＲＮＡｍＲＮＡｃｅＲＮＡ调控网络ꎮ使用ＤＳｉｇＤＢ数据库预测关键基因的药物分子ꎮ结果

纳入炎症性肠病样本３０５例和健康样本４０例ꎬ共筛选出１５０个共表达ＤＥＧｓꎮ功能富集分析(ＧＯ)显示多数ＤＥＧｓ

参与对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应和细胞对生物刺激的反应的生物过程ꎮＫＥＧＧ通路富集分析显示ꎬ

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ＤＥＧｓ主要集中在ＩＬ１７信号通路、补体和凝血级联与ＴＮＦ信号通路等多个信号通路ꎮ通过ｓｔａｒＢａｓｅ数据库、

ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ数据库和ｍｉＲＤＢ数据库预测的靶向ｍｉＲＮＡ和ＬｎｃＲＮＡＤｉｓｅａｓｅ数据库预测的ｌｎｃＲＮＡ构建１个包含２种

ｌｎｃＲＮＡ、１０４种ｍｉＲＮＡ和１３３种ｍＲＮＡ的ｃｅＲＮＡ调控网络ꎮ同时预测了黄体酮ＣＴ关键基因的药物分

子ꎮ结论研究分析了ＩＢＤ差异表达基因的生物学功能ꎬ并构建了１个与ＩＢＤ相关的ｃｅＲＮＡ调控网络ꎬ为ＩＢＤ发病

机制的研究提供了新方法和思路ꎬ以及为ＩＢＤ的诊断和有效治疗提供潜在分子靶点ꎮ

【关键词】ＩＢＤꎻ生物信息学分析ꎻ竞争性内源性ＲＮＡ

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【中图分类号】Ｒ３４９.６４【文献标识码】Ａ【文章编号】１００２７３８６(２０２５)０４０５３３０７

ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅｓａｎｄｃｅＲＮＡｒｅｇｕｌａｔｏｒｙｎｅｔｗｏｒｋｉｎｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙｂｏｗｅｌｄｉｓｅａｓｅｂａｓｅｄｏｎ

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ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓＨＡＯＳｈｕａｉꎬＨＥＮａꎬＦＥＮＧＧｏｎｇꎬｅｔａｌ.ＴｈｅＦｉｒｓｔＡｆｆｉｌｉａｔｅｄＨｏｓｐｉｔａｌｏｆＸｉ’ａｎＭｅｄｉｃａｌ

ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＳｈａａｎｘｉꎬＸｉ’ａｎ７１０００６ꎬＣｈｉｎａ

【Ａｂｓｔｒａｃｔ】ＯｂｊｅｃｔｉｖｅＩｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙｂｏｗｅｌｄｉｓｅａｓｅ(ＩＢＤ)ｉｓａｃｈｒｏｎｉｃｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙｄｉｓｅａｓｅｗｉｔｈｃｏｍｐｌｅｘ

ｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓａｎｄｕｎｋｎｏｗｎｅｔｉｏｌｏｇｙꎬｗｈｉｃｈｓｅｖｅｒｅｌｙａｆｆｅｃｔｓｔｈｅｑｕａｌｉｔｙｏｆｌｉｆｅｏｆａｆｆｅｃｔｅｄｐａｔｉｅｎｔｓ.ＣｏｍｐｅｔｉｎｇｅｎｄｏｇｅｎｏｕｓＲＮＡ

(ｃｅＲＮＡ)ｐｌａｙｓａｎｉｎ