利用SSR 技术构建多花黑麦草品种指纹图谱.docVIP

Online system: 农 业 生 物 技 术 学 报 Journal of Agricultural Biotechnology 2013, 21(7): 799~810 DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2013.07.006 研究报告 Letter 利用 SSR 技术构建多花黑麦草品种指纹图谱  罗永聪*  马啸*  张新全** 四川农业大学草业科学系，雅安 625014 *同等贡献作者 **通讯作者，zhangxq@  摘  要 通过构建我国多花黑麦草主栽品种的 SSR 标记指纹图谱数据库，以实现对多花黑麦草品种的快 速、准确鉴定。本研究利用 SSR 标记，基于多态性高、稳定性强和连锁群分布均匀的原则，从 100 对多花 黑麦草(Lolium multiflorum Lam.)基因组来源的 SSR 引物中，筛选出 12 对引物用来构建了 21 个多花黑麦草 品种(系)的指纹图谱。12 对 SSR 引物共扩增出 108 种多态性基因型，多态性比率达 94.15%，每对引物的 基因型从 5~22 种不等，平均每对引物扩增出 9 种基因型，多态性信息量(PIC)变幅为 0.744~0.934，平均为 0.843，此 12 对引物可以在构建多花黑麦草品种 DNA 指纹数据库作为核心引物推荐使用。21 个多花黑麦 草品种(系)基因型间遗传相似性系数在 0.4956~0.8571 之间，UPGMA 聚类分析表明，在相似系数 0.69 处 可将全部材料分为 3 大类。7 对引物在 9 个品种上具有唯一特征带，采用 15-08C 单对引物即可将 21 个多 花黑麦草品种完全区分开，该对引物不仅多态性高(PIC=0.934)，且具备多个品种的特征谱带。基于该引 物建立了供试品种指纹图谱标准模式图，每个品种具有唯一的指纹图谱(带型)，为牧草品种的审定和保 护以及选配优良杂交组合培育新品种提供了重要的理论依据。 关键词 多花黑麦草，SSR 标记，指纹图谱，品种 DNA Fingerprinting of Annual Ryegrass(Lolium multiflorum Lam.) Varieties Using SSR Makers  LUO Yong-Cong*  MA Xiao*  ZHANG Xin-Quan** Key Laboratory of Grassland Science, Sichuan agricultural university, Yaan 625014, China * The authors who contribute equally ** Corresponding author, zhangxq@  Abstract  The aim of this study is to construct a DNA fingerprinting database of 21 annual ryegrass (Lolium multiflorum Lam.) varieties using SSR makers, which is necessary to annual ryegrass varieties identification and germplasm management. The 21 annual ryegrass varieties or strains in the experiment, including the most domestic varieties, introduced varieties and six strains which were cultivated by our research group, were all tetraploid. Since annual ryegrass belongs to the typical cross-pollinated species, the sampling strategies were closely related to the authenticity and efficiency of molecular genetic diversity analysis and the DNA fingerprinting database. On the basis of others and our previous research experience, we took the bulked DNA samples of 20 individual plants for each group in the experiment. Twelve ev