染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质相互作用中的应用.pdfVIP

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2017-09-15 发布于重庆
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染色质免疫沉淀技术在研究DNA与蛋白质相互作用中的应用.pdf

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维普资讯遗传 HEREDITAS(Beijing)27(5)：801～807，2005 技术与方法染色质免疫沉淀技术在研究 DNA与蛋白质相互作用中的应用王春雨，石建党，朱彦，张琚 (1．南开大学分子生物学研究所，教育部生物活性材料重点实验室，天津 300071； 2 美国塔芙茨大学医学院，圣伊丽莎白医学中心心血管研究所分子生理学实验室，波士顿，马萨诸塞 02135—2997，美国) 摘要：在后基因组时代，DNA．蛋白质的相互作用是研究基因表达调控的一个重要领域。与其他方法相比，染色质免疫沉淀技术 (chromatinimmunoprec tationassay，CHIP)是一种在体内研究 DNA-蛋白质相互作用的理想的方法。近年来这种方法与 DNA芯片和分子克隆技术相结合，可用于高通量的筛选已知蛋白因子的未知 DNA靶点和研究反式作用因子在整个基因组上的分布情况，这将有助于深入理解 DNA-蛋白质相互作用的调控网络。总结了染色质免疫沉淀技术的方法，特别介绍了使用这些方法取得的最新进展。关键词：DNA-蛋白质相互作用；染色质免疫沉淀技术 (CHIP)；DNA芯片；ChlP-克隆中图分类号：Q78 文献标识码：A 文章编号：0253—9772(2005)05—0801—07 ApplicationofChromatin ImmunoprecipitationAssay in DeCiphering DNA．Protein InteraCtjonS WANG Chun．Yu。，SHlJian—Dang。，ZHU Y8．13。～，ZHANG Ju0 (1 TheKeyLaboratoryofBioactiveMaterials，MinistryofEducetion，InstituteforM olecularBiology，NankaiUniversity， Tianjin300071，China：2 LaboratoryofMolecularPhysiology，DivisionofCerdiovascularResearch，St Elizabeth’S Medico／Center，TuftsUniversitySchoolofMedicine，Boston，MA 02135—2997．USA) Abstract：Inthepost-genomicera，identifyingandcharacterizingvariousDNA-proteininteractionsareamajorchal- lenge intheresearchofgenetranscriDtiOnaIregulation．Althoughmanytechniquescanbeusedforthispurpose，chro- matin immunoprecipitationassay (ChIP)，bycontrast，isideallysuitedforstudyingDNA-proteininteractions 门『vivo In recentyears，standardChIPassayhasbeenmodifiedtouncoversomeknownfactors’unknowntargetsequences，es- peciallywhen combinedwithDNA microarrayandmolecularcloningstrategies．These