ITS序列在天门冬属物种DNA条形码构建中的应用研究.pdfVIP

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第 45卷第 3期 华 中师范大学学报 (自然科 学版) Vo1.45 NO.3 2O11年 9月 JOURNAIOF HUAZHONG N0RMAIUNIVERSITY(Nat.Sci.) Sepc.2011 文章 编号 :l000—1190(2011 ITS序列在天门冬属物种 DNA 条形码构建中的应用研究 蒋向辉 。,曾桂萍 ,欧立军 ,余朝文 ,许 栋 (1.怀化学院 生命科学系 ,湖南 怀化 418008;2.贵州大学 农学院;贵阳 550025; 3.怀化学院 民族约用植物 资源研 究与利用湖南省重点实验室,湖南 怀化 418008) 摘 要 :住对天f】冬属 4个种 ITS(internaltranscribedspacer)序列克隆测序的基础 L,并埘 4个 种进行序列比较分析.结果表明:(1)4个物种的亲缘关系很近 ,它们 间的 ITS序列的变异小 ,GC 含量高 ,在 6O 左右 .(2)4个物种在系统树上聚为一类 ,文竹与其他 3种天 门冬 的亲缘关系相对 较远 ,处于系统树 的一支 ,其 中,非洲天 门冬与新疆天门冬 的亲缘关系较近 ,处于系统树 的一支. (3)ITS序列 的种间差异值略有不相 ,短梗天 门冬与非洲天 门冬 的差异值为 2.8 ,与新疆天 ¨冬 的差异值为 3.5 ,与文竹 的差异值为 8.5 ,非洲天 门冬与新疆天 门冬 的差异值为 2.1 ,与文竹 的差异值为 8.3 ,新疆天 门冬与文竹的差异值为 9.1 .综合分析认为 :以ITS序列为 DNA条形 码可 真实反应 天门冬属物种 间差异. 关键词 :ITS序列 ;天门冬属 ;1)NA条形码 中图分类号 :Q819 文献标识码 :A 天门冬属 (AsparagusI)属 合科 ,世界上约 基因问序列可 以对植物物种进行 DNA条形编码. 有 300种 ,除美洲外 ,全世界温带至热带地 区都有 ITS之所以在植物种质资源鉴定及分f系统 分布 ,原产于西伯利 亚至非洲南部 ,我 国有 24种 , 学 中得到广泛应用 ,主要基于 以下两个方面 :第一 , 广布于南北各省.该属植物 中天 门冬为常用中药, 作为 18S和 26SrDNA 的组成部分 ,ITS在核基 因 具有养 阴润燥 ,清肺 生津的作用 ,根据 2005年版 组 中高度重复 ,而且通过不等交换和基 凶转换 ,这 《中华人民共和国药典 》规定天 门冬 的干燥块根人 些重复单位问已经发生 了位点内和位点 问的同步 药 ,但在我国许多地方对中药用的天门冬常与其相 进化 。,即不同 ITS拷贝问的序列趋于相近或完 近的一些种混用 ,如羊齿天门冬、西藏小茎叶天冬、 全一致 ,这就为对 PCR产物直接进行测序奠定 了 西藏天门冬等在少数地 区亦作灭 门冬入药 .中药 理论基础 J.第二,DNA 测序工作 的难易程度及 材品种混乱 问题 ,是长期困扰中医药界的一个大 问 成本与 DNA 片段长度有密切关系 ,裸子植物 lTS 题 ,但至今术得到根本解决 ,给人 民群众用药安全 区的长度变化范 围很大 】,而被子植 物 的 ITS 区 造成威胁.DNA条形码技术是分类学 中辅助物种 长度则 比较稳定,包括 5.8SrDNA在 内,总长度只 鉴定的新技术 ,可 以用 于进行物种 的鉴定、发现新

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