ERIC-PCR技术特点及其应用.pdfVIP

维普资讯 安徽农业科学。JoumalofAnh Agn．Sci．2007。35(18)：5358—5360 责任编辑 孙红忠 责任校对 李洪 ERIC．PCR技术特点及其应用 李犹平，倪学勤 (四川农业大学动物科技学院，四川雅安625o14) 摘要 ERIC序列是近年来发现的存在于原核生物基 因组 中一类短的重复序列。该序列在染色体上的分布和拷贝数具有种间的特异 性，根据序列中心高度保守的44bp的ERIC核心序列设计反向引物，可扩增 出反映细菌基因组结构特征的谱带。由于ERIC—PCR快速简 便，图谱重复性好，能用于细菌分类鉴定、环境监测、污染治理以及人和动物肠道茵群结构研究等方面。 关键词 ERIC；IRU；ERIC—PCR；特点；应用 *llil~类号 Q503 文献标识码 A 文章编号 0517—66ll(2O )l8—05358—03 CharacteristicandAt~iieationoftlleEnterobacterialRepetitiveIntergenicConsenstl~PCR LIyou-pnigetal (CollegeofAnimalScienceandTechnology，SichuanAgriculturalUniversity，Yaan，Sichuan625014) Abstract EnterobacterialRepetitiveIntergenicConsensus(ERIC)，akindofshoflduplicationsequences，isfoundtoexistinthegenomeofprokaryoticor- g~ism．DistributionandcoW ofhtesequenceinchromosomeisniterspecificspecificiyt．Accordingtohtehighlyconservativecoresequence，44bp，reverse primeriSdesigned．ERIC．PcRcangenerateuniquefmgerprintstoreflcethtestructuralfeatureofbacterials位Iirls．andCallidentificationspecies．ERIC— PCR techniquecanbeusednihteidentifiactionofbacterium，environmentalmonitoring，investigationnitestinalfloraofhumanbeingsnadnaimals，whichiS rapid，simpleandrepetitive． ’ Keywords ERIC；Ⅱ{ ；ERIC—PCR；Characteristic；Appliaction 传统的微生物分类鉴定方法是基于微生物的表型特征， ERIC的功能 目前还不太清楚，只是根据它的结构作了 如生长、营养、生理生化等，只能检测可培养的细菌，且费时、 一 些猜测。认为位于基因3末端的ERIC可能由于形成二级 费力，易受操作方法影响。近年来随着分子生物学技术的发 结构后，其茎环结构防止外切核酸酶对基因3末端的降解， 展 ，如PFGE、RFLP、ARDRA、RAPD-PCR、DGGE-PCR、ERIC．PCR 促进上游基因的表达；ERIC在基因组间的位置和拷贝数具 等越来越多地应用于微生物种群结构特征 ，系统多样性和动 有种属特异性，可能该序列本身就为DNA提供某些结构或 力学变化等方面的研究。这些技术克服了传统方法的局限 功能相关的信息，这些信息被核酸代谢相关的特定蛋白识 性，在微生物的分类鉴定中发挥越来越大的作用。ERIC．PcR 别，从而影响核酸的代谢，或者提供位点用于在类核中组织 技术是利用ERIC序列中的高度保守区来设计的一对反向引物 染色体；大多数ERIC是可以转录的，在mRNA中的茎环结构 进行PCR扩增 ，因此通过该技术扩增基因组DNA，构建 DNA指 可能干扰核糖体与