家蝇转铁蛋白基因的克隆和生物信息学分析.pdfVIP

第 lO卷 第4期 生 物 信 息 学 Vo1．1ONo．4 2012年 12月 ChineseJournalofBioinofrmatics Dec．，2012 doi：10．3969／j．issn．1672—5565．2012．04．02 家蝇转铁蛋白基因的克隆和生物信息学分析 龚晓林 ，张 洁 ，李显航 ，刘红美 (1．贵阳医学院图书馆技术部，贵州 贵阳550004；2．贵阳医学院医学生物技术教研室，贵州 贵阳550004) 摘 要：为了研究家蝇转铁蛋白基因功能，获得全长cDNA序列并对其蛋 白序列进行生物信息学分析，利用在线分析程序和相 关工具软件分析转铁蛋白基因的开放读码框，分析编码蛋白的理化性质、结构域、并预测其空间结构和功能。结果表明家蝇 转铁蛋白基因编码蛋白由622个氨基酸组成，分子量为70．58kDa，理论等电点为5．33，为稳定蛋 白，有跨膜区，含有信号肽，该 蛋白属于TR—FER保守结构域家族，亚细胞定位于细胞核，二级结构以无规则卷曲为主，功能预测该蛋白具有酶活性。 关键词：家蝇；转铁蛋白；生物信息学 中图分类号：Q518．2 文献标识码：A 文章编号：1672—5565(2012)一04—234～04 Cloningandbioinformaticsanalysisoftransferrin geneofMuscadomestica(Housefly) GONGXiao．1in ，ZHANGJie ，LIXian．hang，LIU Hong—mei (1．DepartmentofTechnologyofLibrary，GuiYangMedwalCollege，GuiYangGuiZhou550004，China 2．DepartmentofMedicalBiotechnology，GuiYangMedwalCollege，GuiYangGuiZhou550004，China) Abstract：ToobtainandperformthebioinofrmaticsanalysisofTransferringeneofMuscadomestica(Housefly)SOas toprovidethebasisforits’functionresearch．Internetonlineproceduresandtherelatedsoftwarewereexploitedto analyzetheopenreadingframe(ORF)ofTransferringene，physicalandchemicalpropertiesofTransferrinprotein andthedomainsoftheprotein，andpredictthespacestructureandfunctionsoftheprotein．TheTransferrinprotein sequencewascomposedof622aminoacidswith70．58kDaofthemolecularweight．Theoreticalisoeleetricpoint was5．33．Theproteinwasstableandhadsturcturesoftransmembraneandsignalpeptide．Theproteinbelongedto thefamilyofTR—FER．Theproteinprobablylocated innucleusanddominatedbyrandom coilsinsecondsturc— ture．Th eProtFunresultshowedtheproteinhasenzymaticactivity． Keywords：Muscadomestica；Transferrin ；Bioinformatics 转铁蛋 白(Transferrin，Tf)是血浆中主要的含 研究发现，转铁蛋 白的功能十分广泛，在细胞呼吸、 铁蛋白质，大小为70～80kD的蛋 白质。结构上，通 能量平衡中起重