水稻gypsy类逆转座子对不同胁迫条件的响应.pdfVIP

第 38卷第 6期 湖南农业大学学报 (自然科学版) Vol1．38NO．6 2012年 12月 JournalofHunanAgriculturalUniversity(NaturalSciences) Dec．2012 D0I：10．3724／SP．J．1238_2012．00591 水稻gypsy类逆转座子对不同胁迫条件的响应 徐玲 ，一，杨静 ，刘林 ，李成云 (1．农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室，云南 昆明，650201；2．保山学院 资源环境学院，云南 保山， 678000) 摘 要：LTR类逆转座子是水稻基因组中数量最多、分布最广的转座元件，其中Ty3-gypsy类所 占比例较大。根 据 Ty3-gypsy类逆转座子逆转录酶的保守区域 ，采用简并引物 ，通过RT-PCR，对 5种胁迫处理(稻瘟菌、水杨酸、 2，D、高盐及组织培养)后的云南地方水稻品种月亮谷的cDNA进行扩增，并测序获得了一批转录片段 ，分析不 同胁迫条件诱导激活的Ty3-gypsy类逆转座子的特点。结果表明：5种胁迫处理都能诱导月亮谷中Ty3-gypsy类 逆转座子的表达；对不同胁迫响应的逆转座子序列大部分同源性较高，且呈交叉分布，仅有少部分具有胁迫响应 的特异性 ，说明很多Ty3-gypsy类逆转座子能对不同胁迫进行响应。 关 键 词：水稻；Ty3-ygpsy类逆转座子；胁迫；响应 中图分类号：Q786 文献标志码：A 文章编号：1007—1032(2012)06—0591—06 Responseofricegypsyretr0transp0s0nstodifferentstressconditions XU Ling ，YANG Jing，LIU Lin，LICheng—yun (1．KeyLaboratoryofAgro-BiodiversiytandPestManagementofEducationMinistryofChina，Kunming650201，China； 2．DepartmentofResourcesandEnvironmentalSciences，BaoshanCollege，Baoshan，Yunnan678000，China) Abstract：LTR retrOtransposonsarethelargestandmostwidely distributedtransposableelementsinrice，ofwhich Ty3-gypsyclassaremorenumerous．Usingdegenerateprimersbasedonconservedregionofreversetranscriptasegenein Ty3-ygpsyretrotransposons，transcriptfragmentswereamplifiedbyRT—PCR andsequencedrespectivelyfrom cDNAs ofricevarieyt Acuchetreatedby5differentstresses( oryza，SA，2，4一D，high—saltandtissueculutre)toanalyzethe characteristicsofTy3-ygpsyretrotransposonsactivatedbydifferentstresses．Theresultsshowedthatallthe5different srtessescould activateTy3-gypsy re仃otransposOn；aminoacidsequencesofreversetranscriptaseofretrotransposons respondingtodifferentsrtesseswerehighlyconservedanddistributedcrossly,onlyfeW ofthem showedspecificiyt of stressresponse，suggestin