同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体的遗传结构.pdfVIP

第3O卷 第 5期 华 中 农 业 大 学 学 报 Vo1．30 No．5 2011年 1O月 JournalofHuazhongAgriculturalUniversity 0ct．2011。624~ 630 同域分布二倍体和四倍体泥鳅群体的遗传结构 周玲玲 张桂蓉 魏开建 邹桂伟 王卫民 梁宏伟。 冉 玮 1．华中农业大学水产学院／农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室，武汉430070； 2．中国水产科学研究院长江水产研究所／农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室，武汉 430060 摘要 采用SRAP标记和线粒体DNA控制区测序方法对武汉和洞庭湖2个二倍体和四倍体泥鳅同域分布 区4个泥鳅群体的遗传结构进行研究。SRAP分析结果表明，18对多态性引物组合在4个泥鳅群体中共检测到 534个位点，每对引物组合检测的位点数为 23~40个 ；各群体的Nei’S基因多样性(^)和Shannon’S信息指数 (D平均值分别为0．205~0．218和0．324~0．341，4个群体间的^以及f差异不明显；基于 Nei’S无偏遗传距离 构建的UPGMA树显示，洞庭湖二倍体和四倍体泥鳅群体亲缘关系最近，先聚为一支，再与武汉四倍体泥鳅聚 为一支，而武汉二倍体泥鳅聚为单独一支。测定了4个泥鳅群体 40个个体线粒体DNA控制区序列片段(932~ 935bp)，发现47个变异位点，共计29种单倍型。洞庭湖四倍体和二倍体泥鳅群体的核苷酸多样性(7r)分别为 0．898 和0．872 ，明显大于武汉四倍体Or=O．465 )和二倍体 (Tr=O．675 )。在同域分布二倍体和四倍体泥 鳅群体中，洞庭湖四倍体遗传多样性略大于洞庭湖二倍体，武汉二倍体则明显大于武汉四倍体。AM0VA分析 表明，泥鳅群体的遗传变异主要来 自群体内(62．68 )，群体间的变异达到37．32 ；群体间成对固定指数 及 Kimura2-parameter遗传距离均显示，洞庭湖四倍体与二倍体泥鳅群体无明显分化，其余群体间均存在显著分 化。控制区序列单倍型Bayesian系统树与SRAP分析所揭示的4个泥鳅群体的亲缘关系相似。 关键词 泥鳅；相关序列扩增多态性；线粒体 DNA控制区；倍性；遗传变异；单倍型 中图分类号 S917；Q347 文献标识码 A 文章编号 1000—2421(2011)05-0624—07 泥鳅 (Misgurnus口g f口如 ￡s)是鳅科 来在鱼、虾遗传结构分析方面得到应用[16q8]。线粒 (Cobitidae)的小型淡水鱼类，是我国重要养殖对象 体DNA(mtDNA)具有结构简单、母系遗传、进化速 和出口创汇品种。我国的泥鳅主要为天然二倍体和 度快等特点，是群体遗传学和系统进化研究的重要 四倍体[]以及极少量天然三倍体和六倍体泥鳅[。。]。标记[1，其中控制区(D-Loop区)是线粒体基因组 探讨不同倍性泥鳅的分布格局以及倍性之间的遗传 中进化速度最快、变异最大的非编码区，广泛应用于 关系，对于阐明泥鳅多倍体形成机制，保护及合理利 鱼类种群遗传结构和遗传多样性研究[2 ，但未见 用泥鳅种质资源具有非常重要的意义。日本对泥鳅 SRAP标记和mtDNA控制区序列应用于泥鳅及其 的倍性[]、群体遗传多样性[]和微卫星遗传图 不同倍性群体遗传研究的报道。 谱L8]等做了较多研究。近年来国内采用 RAPD和 笔者采用SRAP标记和mtDNA控制区序列分 SSR标记对泥鳅部分群体 的遗传变异进行 了研 析方法对湖北省武汉市和湖南省岳阳洞庭湖区2个 究[9Iu]，但对不同倍性泥鳅之间遗传关系的报道极 少[ 。 二倍体和四倍体泥鳅同域分布区内4个泥鳅群体的 相关序列扩增多态性 (SRAP)是一种新型的旨 遗传结构和亲缘关系进行分析，旨在为探讨不同倍 在扩增开放阅读框 (ORFs)的分子