纤毛虫原生动物系统发生学研究进展.pdfVIP

中国科技论文在线 纤毛虫原生动物系统发生学研究进展# 伊珍珍* （华南师范大学生命科学学院，广州 510631） 5 摘要：回顾了纤毛虫系统发生学的研究进展，简要介绍了化石、形态发生特征等在纤毛虫系 统发生树推断中的应用及局限，重点介绍了分子系统学研究中常用基因标记（核基因：核 rRNA 和蛋白质编码基因；线粒体基因：细胞色素氧化酶I、细胞色素b 等）、系统树构建 等相关研究。最后，探讨了纤毛虫分子系统学研究主要存在的问题及以后的发展方向。 关键词：动物学；纤毛虫；系统发生；基因标记；系统树构建 10 Phylogenetic Analyses of Ciliate Protozoa YI Zhenzhen (College of Life Science, South China Normal University, GuangZhou 510631) Abstract: In this paper, ciliate phylogenetic study is reviewed. Fossil and morphological 15 characters are rarely used in ciliate phylogenetics, since their numbers are limited. Gene markers and tree construction are mainly discussed in the paper. Gene marker generally used include both nuclear genes (rRNA and protein-coding gene) and mitochondrial genes (Cytochrome c oxidase I, cytochrome b) and so on. Furthermore, problems in present investigation and optimistical future researches are discussed. 20 Keywords: Zoology; ciliates; phylogeny; gene marker; tree construction 0 引言 系统发生（Phylogeny ）是指一群有机体发生或进化的历史。系统发生树(phylogenetic tree) 就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓扑结构。重构地球上所有生命的进化史，并以系 25 统树的形式表述出来，是每一个生物学家的梦想，也是生物学科最重要的基础研究问题之一。 系统进化研究有助于人们更好地了解并保护生物及生态系统，为其他相关研究提供基础[1]。 最早的系统发生研究可追溯到1859 年Darwin 的《物种起源》 [2, 3] 。早期以化石、形态学、 生理学、解剖学、细胞学、化学等特征构建系统发生树。20 世纪60 年代，分子系统发育学 （molecular phylogeny ）的建立开创了利用分子标记研究生物系统发育的途径 [4] 。由于生 30 物大分子本身就是遗传信息的载体，含有庞大的信息量，且趋同效应弱，因而分子系统学的 结论更具有可比性和客观性。现今，随着分子生物学技术和计算机数据处理技术的迅速发展， 分子系统学在研究各种生物类群间的亲缘关系、起源与进化等方面得到了广泛的应用。 1 早期纤毛虫系统发生研究概况 纤毛虫原生动物属于微型真核生物，种类多样性极高，是原生生物中形态多样性最高的 35 类群。由于