椅式环己烷三维结构模型在SigmaPlot软件中的实现.pdfVIP

广东微量元素科学 2009盔 GUANGDONGWEILIANGYUANSUKEXUE 第 l6卷第2期 文章编号：1006—446X (2009)02—0068—03 椅式环 己烷三维结构模型在 SigmaPlot 软件中的实现 郑明彬 李尚德 吴喜仁 梅 俊 (广东医学院化学教研室，广东 东莞 523808) 摘 要：通过SigmaPlot软件的应用实例，介绍了该软件的三维、二维离散数据绘图功能，研究了 构造模型的方法、操作步骤。结果表明，利用该软件的绘图功能可成功构造椅式环己烷三维结构 模型，并且给出此模型在不同平面上的投影图。 关键词：SigmaPlot软件；环己烷；绘图 中图分类号：TP317．4 文献标识码：A SigmaPlot10是Systat软件公司推出的集图形绘制，数据分析为一体的综合应用软件。它功 能强大，使用方便、快捷，因而在学术科研中受到青睐 J。该软件采用直观的、图形化的、面 向对象的窗口菜单和工具栏操作实现计算、绘图和曲线拟合等数据分析功能。用SigmaPlot处理 化学实验数据，不用编程，只要输入测量数据，然后再选择相应的菜单命令，点击相应的工具按 钮即可。但是，该软件在有机分子模型的构造 尚未见报道。本文利用SigmaPlot的精确绘图功能 开发构造椅式环己烷三维立体结构模型。 1 椅式环己烷三维结构模型的精确构造与绘制 1．1 建立坐标系 根据椅式环己烷的结构特点建立三维坐标系，使其坐标原点放在分子的三重旋转轴和二重旋 转轴的交点上，Z轴与三重轴重合，以确立各原子的相对位置 。 1．2 原子坐标参数化 根据椅式环己烷分子各碳原子在坐标系中的位置，将其 表 1 椅式环己烷三维模型数据 坐标参数化 C，(0．58，0，0．29)、C (0．29，1，一0．29)、 C3(一0．29，1，0．29)、C4(一0．58，0，一0．29)、C5(一 0．29，一1，0．29)、C(0．29，一1，一0．29)。其中括号内的 数值为相应的 ，y，z坐标参数。 1．3 绘图工作表的建立以及3D、2D—scatter图形的绘制 由椅式环己烷分子中各原子坐标参数建立 3D—Scatter 绘图表格如表 1。 收稿 日期：2008—12—04 基金项 目：广东省科技计划项 目(2oo7Bolo6oo38)；广东省科 技计划项 目(2006；广东医学院青年基金 (xQo71s) 作者简介：郑明彬(198O一)，男，(汉族)，湖南衡山人，讲师，硕士研究生，主要从事计算机化学应用研究。 · 68 · 广东微量元素科学 2009盔 GUANGD0NGWⅡ GYUANSUKEXUE 第 16卷第2期 启动SigmaPlot10，将表 1所示的 、y、z 数据分三列输入相应的表格中，然后选择 “3D ScatterPlot”按钮 或在 Graph菜单 下选择 1 “CreatGraph… ”调用 “3D ScatterPlot”，选 择 X“YZTriplet”项完成环己烷中的6个碳原 子的绘 制。双 击 图像 定 义 “Symbols”的 “ size”为 10．0mm，定义 “Lines”的 “Type” 为 “Solid”、 “Thickness”为2．0mm，再稍加 修饰，生成如图1所示的图像。 选择 “Line／ScatterPlot”按钮 中 “Simple StraightLineScatter”项或在 Graph菜单下选 择 “Line／ScatterPlot”调用 “SimpleStraight LineScatter”，选择 “XYPair”项 以 、y列 数据绘制椅式环 己烷在 XY平面的投影 图。同 图1椅式环己烷三维结构模型 样绘制椅式环己烷在 YZ、XZ平面的投影图。。