稻瘟病菌几丁质结合蛋白的生物信息学分析.pdfVIP

中国蓉擘c童提 2011,27(21)：239—245 ChineseAgriculturalScienceBulletin 稻瘟病菌几丁质结合蛋白的生物信息学分析 林雄杰 ，周 洁 ，王宗华 ，鲁国东 (福建农林大学植物保护学院，福州350002；福建农林大学生命科学学院，福州350002； 福建农林大学，福卅I350002) 摘 要：为了弄清稻瘟病菌数据库中可能的几丁质结合蛋白的分布及其结构特点，从而为进一步进行编 码基因的功能研究打下 良好基础。通过生物信息学技术对稻瘟病菌基因组中假定的几丁质结合蛋 白的 结构域、亚细胞定位及EST等进行分析，同时构建了系统发育树 ，并预测了这些蛋 白在不同发育时期和 不同组织中的表达特点。结果共得到了23个可能的几丁质结合蛋白，它们在7条染色体上的分布并不 均匀；绝大多数的几丁质结合蛋 白都定位在胞外。稻瘟病菌几丁质结合蛋 白在不同发育时期和不同组 织中的表达也各不相同；不同真菌间的几丁质结合蛋白相互交错，它们之间的进化关系十分复杂。 关键词：生物信息学；稻瘟病菌；几丁质结合蛋 白；EST 中图分类号：$435．1l1．41 文献标志码 ：A 论文编号：2011—1015 BioinformaticsAnalysisofChitinBindingProteinFamilyinM agnaportheoryzae LinXiongjie，ZhouJie，WangZonghua，LuGuodong (PlantProtectionCollegeofFujianAgricultureandForestryUniversity，Fuzhou350002； 2SchoolofLfieSciencesofFujianAgricultureandForestryUnivers Fuzhou350002； FujianAgricultureand ForestryUniversity，Fuzhou350002) Abstract：Inordertoknow thedistributionandstructuralfeaturesofhypothetical chitin-bindingproteinin Magnaporthegriseadatabase，whichwouldmayagoodfoundationonfurtherresearch intheencodegenes function．In thispaper，bioinformaticsapproacheswereusedtoanalyzethedomains，subcellularlocalization ESTandphylogenetictreeconstructionofputativechitinbindingproteins(CBP)inthegenomeofMagnaporthe orfzae,andpredictthegeneexpressioncharacteristicsindifferentdevelopmentalstagesanddifferenttissue．In total，23 putativeCBP familyproteinswereretrievedfrom thegenome，which distributed inequable in 7 chromosomes，themajorityofCBPwerelocalizedintheextracellular．TheexpressionofCBPindifferent developmental stagesanddifferenttissuesweredifferentinMagnaportheoryzae．Thechitinbindingproteins interlacedbetweendifferentspeciesfungi，theevolutionaryre