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第 2l卷 第 l期 淮海工学院学报 (自然科学版) VoI_2l NO.1
2012年 3月 _】ournaloflquaihaiInstituteofTechnology(NaturalScienceEdition) M ar.2Ol2
I)()I:10.3969/j.issn.1672—6685.2012.O1.006
基于 Matlab的甲壳动物线粒体 DNA的点突变检测方法
耿 帅 。,韩 磊 。,孟 娇 。
(1.中国矿业大学 信息与 电气工程学院,江苏 徐州 221116;2.淮海工学院 电子工程学院.江苏 连云港 222005)
摘 要 :近年来对基因突变检测的研究越来越受到A-4tl的重视 ,很多基 因突变仅是由于单碱基替换
所致,如何快速简便地进行检测、发现该点突变具有重要意义’。甲壳动物的线粒体基因组蕴含 了物
种进化历程 中重要 的遗传信息,针对甲壳动物线粒体基 因序列,提 出一种基于Matlab的检测基 因
序列点突变的简单方法。仿真实验证明,该方法对甲壳动物线粒体基 因序列的突变检测和突变基
因位置的定位是有效可行的。
关键词:Matlab;GUI;基 因序列;基 因突变;点突变
中图分类号:Q754;TP391 文献标识码 :A 文章编号:1672—6685(2012)01—0025—04
PointM utationDetectionM ethodBasedonM atlabof
CrustaceanM it0ch0ndriaDNA
GENG Shuai一。HAN Lei ,MENGJiao’。
(1.SchoolofInformationandElectricalEngineering,ChinaUniversityofMiningandTechnology,Xuzhou221i16,China;
2.SchoolofElectricalEngineering,HuaihaiInstituteofTechnology,Lianyungang222005,China)
Abstract:In recentyears,moreandmoreattentionhasbeenpaidtostudiesongenemutations.
Manygenemutationsareonlycausedbythesinglebasesubstitution,andhow todetectandfind
thiskindofpointmutationquicklyandeasilyhasgreatsignificance.Crustaceanmitochondrialge—
nomecontainstheimportantgeneticinformationofspeciesevolution.Forthemitochondrialgene
sequenceofcrustaceans,thispaperpresentsasimplepointmutationdetectionmethodbasedMat—
lab.Thesimulationresultsprovethismethodtobefeasibleandeffectivefordetectingthemuta—
tionandlocatingthemutationgeneofthemitochondrialgenesequenceofcrustaceans.
Keywords:M atlab;GUI;genesequence;genemutation;pointmutation
甲壳动物是后生动物中形态结构和栖息环境差 的核酸、氨基酸序列和基因顺序信息,使之为甲壳动
异、多样性最高的动物类群 ,它们在海、淡水域环境 物的系统发展研究服务 ,是 甲壳动物线粒体基 因组
中的优势地位 、巨大产量 、生态意义和在渔业生产中 研究亟待解决的一个问题 。目前,对 甲壳动物线粒
具有重
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