真菌分类鉴定研究进展.pdfVIP

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第33卷第4期 工工 Vo1.33No.4 2010年 4月 Apr. 2010 真菌分类鉴定研究进展 朱研研,王耀耀,付美红,刘云清,郝惠云,王亚莉 (华北制药集团新药研究开发有限责任公司,河北 石家庄 050015) [摘 要]阐述了真菌分类的传统分类方法和几种分子生物学方法,传统分类学主要 以形态学为主;分子生物学方法主要有 DNA中G+C含量测定、核酸杂交技术、限制性酶切片段长度多态性分析、随机扩增多态性DNA(RAPD)、rDNA序列同源性分析。 [关键词]真菌:传统分类学:分子生物学 [中图分类号]Q949.32 [文献标识码]A [文章编号]1003—5095(2010)04-0037-03 真菌分布广泛、种类繁多。真菌分类系统有De 了前景嘲。 Bary (1884)系统、Gaumann (1962)系统 、Martin 2.i DNA中G+C(mol’5)含量测定 (1950)系统 、Whitake (1969)系统和 Ainsworth 这是最早用于真菌分类学研究的分子生物学技 (1973)系统等[1]。传统的分类鉴定方法主要是表型分 术。特别是在酵母菌中,GC值已成为分类学上的常规 类法,是以形态和生理化特征为依据,时间较长 (一般 工具[4]。因为每种真菌都有固定的G+C(oto1%)范围且 2~3个月)。近年来分子生物学技术的发展,PCR技术 较为稳定,不同生物种的G+C含量是不同的,生物种 的应用,开辟了真菌分类鉴定的新途径。 目前分子生 之间的亲缘关系越远,其 G+C含量差别就越大,一般 物学鉴定技术具有.决速、简便、分辨率高的特点,并可 G+C(oto1%)相差 2%以内被认为同一种内的相同菌株 , 进行多相分类鉴定,能按照种系进化的关系确定精确 两个菌株G+C(mol%)差别为 4%~5%,可以认为是同一 的位置和定种,使分类鉴定方法更客观合理。主要的 种内的不同菌株,差别为 i0%~15%,可 以认为是同属 分子生物学技术有DNA中G+C(oto1%)含量测定;核酸 内不同种,若差别为 20%~30%,则认为是不同属或不 杂交技术;限制性酶切片段长度多态性分析;电泳核 同科内的真菌[3]。但是丙个落株的DNA碱基组成相同, 型 (EI()分析;随机扩增多态性DNA(RAPD)分析;rDNA 而 DNA序列的同源性很差,两者之间的亲缘关系不一 序列分析 ;多位点酶切电泳 (NEE)。 定很近。因此 G+C(mo1%)主要作用在于否定,即G+C 1 真菌的传统分类方法 (mo1%)之不同,可以认为是不同的菌,而 G+C(m01%) 各种生物的分类系统都是以形态特征为分类基 值相同的却不一定是相同菌,还要借助于其他鉴定手 础而发展起来的,表型研究对于分类学来说尤为重 段加以定论。 要。以形态学特征为主,生理生化 、细胞化学和生态等 2.2 核酸杂交技术 特征为辅是真菌的重要分类途径 。但是真菌种类繁 核酸杂交技术是认知真菌系统发育和进化的有 多、形态特征复杂,又缺乏标准统一的描述,具有非常 力工具和较有说服力的手段之一[5]。一般在相同的菌 大的主观性,而且有的菌种形态特征和生理生化指标 种中,DNA/DNA杂交的成功率高达 80%以上,若低于 受多种因素的影响而不稳定。真菌形态学研究最大的 20%基本可考虑为无关菌系,65%~80%之间的菌有较 缺点是不能应用于暂时还不能人工培养的真菌中2[]。

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