粳稻为背景的普通野生稻单片段代换系群体的初步构建.pdfVIP

粳稻为背景的普通野生稻单片段代换系群体的初步构建.pdf

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广西农业科学 2010,41(4):297—302 GuangxiA culturalSciences ·297 · 粳稻为背景的普通野生稻单片段代换系 群体的初步构建 宋建东t一,黄悦悦一,阳海Tt一, 加兴z一,马增凤z一,刘 驰z一,黄大辉z一, 张月雄一,李孝琼 ,黄金艳 ,李容柏 ‘ (1广西大学生命科学与技术学院,南宁 530005;2广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,南宁 530007; 3广西大学农学院,南宁 530005;4广西农业科学院水稻研究所,南宁 530007) 摘要:以粳稻日本晴(0.sativaL.subsp.Japonicacv.Nipponbare)为受体和轮回亲本,以广西普通野生稻核心种质 DP15为供体,通过连续回交和SSR标记辅助选择的方法构建普通野生稻单片段代换系群体(Singlesegmentsubstitution lines,sssk)。用覆盖水稻全基因组的563对SSR~I物检测供体(DP15)和受体(日本晴)的多态性,从中挑选212对分布 在水稻12条染色体上的多态性引物跟踪供体基因型。结果表明,在BC3F。代获得79个代换片段,这些片段基本上能相 互重叠并覆盖水稻12条染色体,其中第1、第2条染色体含有的代换片段数最多,均为9个,第9、第1O和第12条染色体含 有的代换片段数最少且均为5个。79个代换片段长度为12.65—113.55cM,平均长度为54.3cM,总覆盖长度为4285.28 cM,是水稻整个染色体组长度的2倍多,覆盖野生稻全基因组达98.89%。随机选取其中的6个代换株系用96个多态性 引物检测其遗传背景,发现供体DNA残留率为7.3%一15.6%。今后将继续通过回交和标记辅助选择,以获得一整套覆盖 普通野生稻全基因组的SSSLN,这将有助于研究稻种的起源、演变和分化以及普通野生稻的功能基因组。 关键词:普通野生稻;粳稻;单片段代换系;标记辅助选择;多态性 中图分类号:$511.9 文献标识码:A 文章编号:1002—816l(2010)o4—0297--06 Preliminarydevelopment0nsinglesegmentsubstituti0nlines population0fc0mm0nwildrice(Oryzaru~ipogon)based0n JapomcaDacKgrouna SONGJian—dong,2 HUANGYue—yueL2 YANGHei—ning一,ZHENGJia—xing 3, MAZeng—feng2,4LIUChi4HUANGDa—hui4 ZHANGYue—xiong2一, LIXiao—qiong,2 HUANGJin—yan2.LIRong—bail,2,4 (1CollegeofLifeScienceandTechnology,GuangxiUniversity,Nanning530005,China;2GuangxiCropGenetic Improvementna dBioteehnologyLab,GuangxiAcademyofAg矗culturalSciences,Narming530007,China; 3AgriculturalCoUege,GuangxiUniversity,Nanning530005,China;4RiceResearchInstitute,GuangxiAcademyof AgriculturalSciences,Nanning530007,China) Ab

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