复杂性疾病生物信息学研究的策略与方法.pdfVIP

P.O.Box 2345 Beij ing 100023, China World Chin J Digestol 2003 October ; 11( 10) :1465- 1469 Fax: +86-10 世界华人消化杂志 ISSN 1009-3079 CN 14- 1260/R Email: wcj d@wj www.wj 2003年版权归世界胃肠病学杂志社 •述评 COMMENTARY • 复杂性疾病生物信息学研究的策略与方法 李 梢,张学工,季 梁,李衍达 李梢,张学工,季梁,李衍达,清华大学生物信息学研究所 生物信息 1遗传-环境的相互作用及基因型-表型复杂的内部 学教育部重点实验室 北京市 100084 李梢,男, 1973-10-22生,安徽徽州人,汉族. 1995年北京中医药大学本 结构 科毕业, 2001年北京中医药大学博士, 2001-2003年清华大学生物信息学研 疾病的发生与环境(环境有害因素)和遗传(遗传易感性) 究所博士后,讲师.主要从事自身免疫和炎症疾病 中医药生物信息学研究. 国家自然科学基金重点资助项目 青年基金项目, No 有关.单基因病(monogenic disease)是疾病发病的遗传因 中国博士后科学基金资助项目, No. 2002-11 项目负责人:李梢, 100084,北京市海淀区清华园1号,清华大学生物信息 素中以单基因缺陷占主导地位 且在家系成员中疾病传 学研究所 生物信息学教育部重点实验室. shaoli@ 电话: 010 递符合孟德尔规律者.复杂性疾病 则是由 收稿日期:2003-06-06接受日期:2003-07-24 多个基因及环境因素(包括致病微生物)相互作用所致 且 在家系中不符合孟德尔规律 又称为多基因病 摘要 diseases)多基因遗传病 多 本文简述近年来复杂性疾病生物信息学研究的策略与方 因子病 如肿瘤 心血管病 代 谢性疾病 [5] [6] 法 并介绍清华大学生物信息学教育部重点实验室的有关 神经-精神类疾病 免疫性疾病 帕 [7] [8] 工作.由于遗传 环境的相互作用及基因型-表型复杂的 金氏症 肠癌 等.由于机体常见的疾病 健康状态 内部结构 常用的家系研究 基于遗传图谱的连锁分析 基 是环境暴露 遗传易感性和年龄等因素复杂交互作用 于物理图谱的定位克隆以及关联分析等单基因病策略与方 的结果 基因-环境各种因素之间往往存在复杂的非线 法 在复杂性疾病的分子机制研究上存在局限.在后基因组 性关系 因此导致研究上存在困难. 时代 生物信息学的发展 为从分子水平和系统观念研究 1.1微效基因的困扰 以及由此导致的预选基因难以 复杂性疾病 以及研究模式从 序列 结构 功能 向 相 选择 复杂性疾病的特点往往是由多个中效 微效基因共 互作用 网络 功能 的转变提供了契机.从多因素分 同决定疾病的复杂性状 仅一个基因的改变对疾病的发 析 基因的相互作用着手研究复杂性疾病成为热点.我们 生 发展 以及对药物作用的影响不大 其中某一或某些