丹参锚蛋白重复序列家族基因的克隆和表达分析.pdfVIP

第41卷 第 4期 陕西师范大学学报 (自然科学版) VoI．41 No．4 2013年 7月 JournalofShaanxiNormalUniversity(NaturalScienceEdition) Ju1．。2o13 文章编号 ：1672—4291(2013)04—0063—04 丹参锚蛋白重复序列家族基因的克隆和表达分析 张 璇 ，库里满 ·恰里甫 武玉翠，王枯之 (陕西师范大学 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室，西北濒危药材资源 开发国家工程实验室，陕西 西安 710062) 摘 要 ：用降落PCR的方法获得 了丹参锚蛋 白重复序列家族基 因(SmARP)．生物信息学显示， SmARP所编码蛋白的分子质量为 19，064kD，理论等 电点为 8．4，是一种不稳 定而且无信 号肽和 无跨膜 区域的蛋 白．该蛋 白的二级结构中主要存在 a螺旋 (39．64 )和无规卷曲(42．0196／)，其三 维结构模型中每个锚蛋 白重复序列折叠成两个反向平行的a一螺旋，每两个a一螺旋中间形成一个长 环．实时荧光定量 PCR结果显示，该基 因在丹参的根 、茎、叶、花 中均有表达． 关键词：丹参；锚蛋 白重复序列家族基因；生物信息学分析 中图分类号：Q517；Q943．2 文献标志码：A CloningandexpressionanalysisofSmARP from Salviamiltiorrhiza ZHANG Xuan，KulimanQialifu，WU YU-CUi，WANG Zhe-zhi (KeyLaboratoryoftheM inistryofEducationforMedicinalPlantResourceandNatural PharmaceuticalChemistry，NationalEngineeringLaboratoryforResource DevelopmentofEndangeredCrudeDrugsinNorthwestofChina， ShaanxiNormalUniversity，Xian710062，Shaanxi，China) Abstract：An ankyrin repeatfamilyprotein gene(S ARP)from Salviamiltiorrhiza wascloned usingTD— PCR．Bioinformaticsanalysisshowedthatthecalculatedmolecularmassis19。064kD， andthe theoreticalisoelectricpointis8．4． Ankyrin repeatprotein in S．miltiorrhiza isan unstableprotein without signalpeptide and transmembrane segments． Predicted secondary structureofSmARP contain，alphahelix(39．64 )and random coil(42．01 )．Thethree dimensionalstructuremodeJofSmARP showed thateach repeatfoldsinto two antiparallela— helicesfollowedbyalong loop．Thereal—timePCR resultsshowedSrnARP expressesinroots， stems，leavesandflowersofS．， Z￡orr矗za． Keywords：Salviamiltiorrhiza；ankyrinrepeatfamilyprotein；bioinformatics 锚蛋白重复序列 (AnkyrinRepeat，ARP)是普遍 与蛋白相互作用的结构平台_3]，对于由多种信号途径 存在于真核、原核及病毒中的一种蛋 白