沼泽型水牛Y染色体微卫星标记的筛选与多态性检测.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2010 年 3 月, 32(3): 242―247 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2010.00242 沼泽型水牛Y 染色体微卫星标记的筛选与多态性检测 张晓明, 乐祥鹏, 张春梅, 蓝贤勇, 陈宏, 雷初朝 西北农林科技大学动物科技学院, 陕西省农业分子生物学重点实验室, 杨凌 712100 摘要: 为了研究水牛 Y 染色体的遗传多样性, 文章以滇东南水牛 3 个地方群体——红河(HH) 、西双版纳(BN) 和普洱(PR)共31 头公牛为研究对象, 选取 14 个家牛Y 染色体特异性微卫星标记, 以检测这些标记在水牛Y 染 色体遗传多样性研究中的可行性。结果表明, 3 个标记(INRA008 、UMN0103 和UMN0504) 只有1 个等位基因, 表 现为单态; 3 个标记(UMN1113 、UMN0304 和 BC1.2)均为 3 个等位基因, 但呈单态; 3 个标记(UMN0920 、 UMN0307 和UMN3008) 呈现无规律的梯状条带, 所以这9 个标记都不适用于水牛的Y 染色体遗传多样性研究; 只有5 个标记(INRA124 、INRA189 、BM861 、PBR1F1 和UMN2001) 具有多态性, 表明适用于水牛的Y 染色体 遗传多样性研究。这5 个多态性Y 染色体特异微卫星标记在滇东南水牛群体中的平均等位基因数(NA)为2.8000, 平均期望杂合度(He)为0.3998, 基因多样性(GD)为0.4144, 多态信息含量(PIC)为0.3245, Shannon 信息熵(SI)为 0.5849, 表明滇东南水牛群体的Y 染色体具有中等遗传多态性。 关键词: 水牛; Y 染色体微卫星标记; 遗传多样性 Screening and polymorphism of Y chromosome microsatellite markers in swamp buffalo ZHANG Xiao-Ming, YUE Xiang-Peng, ZHANG Chun-Mei, LAN Xian-Yong, CHEN Hong, LEI Chu-Zhao Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture, College of Animal Science and Technology, Northwest A F University, Yangling 712100, China Abstract: To understand the genetic diversity of buffalo Y chromosome, 14 microsatellite markers specific for cattle Y chromosomes were used to analyze 31 male buffaloes of three populations (i.e., HH, BN, and PR) originating from south- eastern Yunnan Province, P. R. China. The aim of this study was to examine the practicability of cattle Y chromo- some-specific microsatellite markers in studying genetic diversity of buffalo Y chromosome. Three markers (