真核生物FANCJ-like蛋白的结构与进化.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2014 年*月, 36(*): 1― 研究报告 真核生物FANCJ-like 蛋白的结构与进化 1 1 1,2 1,2 吉克伍合 ，武泽峰 ，范三红 ，奚绪光 1. 西北农林科技大学生命科学学院，杨凌 712100； 2. 旱区作物逆境生物学国家重点实验室，杨凌 712100 摘要：FANCJ-like 蛋白是一类ATP 依赖的5 ′-3 ′DNA 解旋酶，参与DNA 损伤修复、同源重组及G4-DNA 拆 解，在基因组稳定性维持过程中发挥重要功能。文章系统分析了47 种真核生物的FANCJ-like 蛋白，对其序列 结构特征及起源进化进行了深入探讨。真核生物 FANCJ-like 蛋白包含 4 类成员——XPD 、CHL1 、RTEL1 和 FANCJ ，但在真菌的一些世系及昆虫中存在严重缺失现象，如接合菌门（Zygomycota ）缺失了RTEL1 ，担子菌 门（Basidiomycota ）和子囊菌门（Ascomycota ）缺失了RTEL1 和FANCJ ，双翅目昆虫缺失了FANCJ 。FANCJ-like 蛋白不仅包含经典解旋酶共有 HD1 和 HD2 结构域，而且在 HD1 结构域中插入了自身特有的 Fe-S、Arch 和 Extra-D 结构域。Fe-S 和Arch 结构域在4 类成员中较保守，Extra-D 结构域在XPD 中不存在，在其他3 类成员 中也各不相同。在FANCJ-like 蛋白的Fe-S、Arch 和Extra-D 结构域中分别发现了7 个、10 个和2 个特有模体； 除了已报道的保守模体外，HD1 和HD2 中分别发现了5 个和 12 个特有模体。从这些特有模体组成和排布来看， RTEL1 和FANCJ 最为相近，它们在HD2 区包含两个独有模体Vb2 和Vc ，可能与其G4-DNA 解旋活性相关。 进化方面的证据表明，FANCJ-like 蛋白起源于一种HD1 区插入了Fe-S 和Arch 结构域的DNA 解旋酶，在多细 胞真核生物出现之前，该蛋白通过3 次复制事件和随后的特异化过程，依次形成了目前真核生物所包含的4 类 FANCJ-like 蛋白。 关键词：FANCJ-like 蛋白；解旋酶；系统发育；保守模体；空间结构 Structure and evolution of the eukaryotic FANCJ-like proteins 1 1 1,2 1,2 Wuhe Jike ，Zefeng Wu ，Sanhong Fan ，Xuguang Xi 1.College of Life Science, Northwest AF University , Yangling 712100, China ; 2.State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas , Yangling 712100, China Abstract : The FANCJ-like protein family is a class of ATP-dependent helicases that can catalytically unwind duplex DNA along the 5’-3’ direction. It is involved in the processes of DNA damage repair, homologous recombination and G -quadruplex DNA unwinding, and plays a critical role in maintaining genome integrity. In this study, we systemically analyzed FNACJ-like proteins from 47 eukaryotic species and discussed their sequences diversity, origin and evolution