东北地区五个引进鸭品种的遗传多样性分析.pdfVIP

中国笨 学莲搪 2009，25(11)：12—15 ChineseAgriculturalScienceBulletin 东北地区五个引进鸭品种的遗传多样性分析 刘 晶’，于 浩 ，鲍永华 ，牛伟萍 ，张金玉 ，赵志辉 ，张明军 (吉林大学畜牧兽医学院，长春 130062；中国农业大学生物学院，北京 100094) 摘 要：通过线粒体D—loop区测序对东北地区的五个引进鸭品种(樱桃谷鸭、长岛鸭、北北京鸭、康贝尔 鸭、白冠鸭)20个个体进行了遗传结构的分析，通过对mtDNAD—loop部分序列进行扩增，对PcR产物经 纯化后进行序列测定，得到了710bp的核苷酸序列。通过Mega软件对所得的序列进行比较，共检测出 86个位点碱基存在变异，其中包括 16个简约信息位点；利用Mega的 “Pairwisedistance”计算个体间的相 对遗传距离。结果表明：其序列差异在O．000～0．082之间，得 出20个个体有 18种单倍型；并构建了系统 发育树。运用DNASP软件计算所得该群体核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样度 (Hd)和平均核苷酸差异数 (K)分别为0．01911、0．9842和13．3588。研究结果表明：鸭种群线粒体D—loop区序列个体变异程度很小， 但种群的遗传多样性水平很高，适合于群体 内及群体间不同个体的遗传多样性分析。 关键词：鸭；线粒体D—loop；系统分析 中图分类号：$603．7 文献标识码：A GeneticStructureAnalysisoffiveIntroducedDuckBreedsinNorth-—EastChina LiuJing，YuHao，BaoYonghua，NiuWeiping，ZhangJinyu， ZhaoZhihui，ZhangMingjun (~CollegeofVeterinaryMedciine，JilinUniversity，Changchun130062； CollegeofBiologicalSciences，ChinaAgriculturalUniversity，Beijing100094) Abstract：ThePCR techniquewasused toanalyzethemtDNA D-loop sequencesin 20individualsoffive duck strains．ThePCR productswerepurifiedand sequenced．Asaresult，aseriesof710bpnucleotide sequencesofpartialD—loopregionwereobtained．ComparingtheD-loopfragmentswitheachotherbyMega software，86 siteswerevariableamongallthepartialmitochondrialD-loopregion sequencesincluding 16 parsimoniousmessagesites．Therelativegeneticdistanceswerecalculatedamongindividualsby “Pairwise distance”methodofMega．Theresultsindicatedthatthedifferentiationofthe20sequencesrangedfrom 0．000 to0．082and showed 18kindsofhaplotypesamong20individualsandconstructphylogenetictrees．The numberofpolymorphicsites(S)was86；thenucleotidediversity(Pi)andtheaveragenumberofnucleotide differences(K)were0．01911and13．3588，respectively．Itcanbeconcludedthatthevariation