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第 20 卷第 2 期 原 子 与 分 子 物 理 学 报 Vol. 20 , №. 2
2003 年 4 月 CHIN ESE JOURNAL OF A TOMIC AND MOL ECULAR PHYSICS Apr. , 2003
文章编号 : (2003)
甘氨酸与水分子间相互作用的理论研究
1 2 3
徐伯华 , 李来才 , 唐作华
( 1. 涪陵师范学院化学系 ,重庆涪陵 408000 ; 2. 四川师范大学化学系 ,成都 610066 ; 3. 四川大学化学学院 ,成都 610064)
( ) ( )
摘要 : 在密度泛函 DFT B3L YP/ 6-311 + + G 3 d , 3 p 水平 ,对中性甘氨酸的最小点结构 Ip 和 H O 分子间
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可能存在的氢键复合物进行全自由度能量梯度优化 ,发现了三个氢键极小结构 A 、C 和 E ,其中结构 A 为最
( )
稳定结构 ,它是 H O 与甘氨酸的羧基 - COOH 形成两个氢键的结构 ,具有 C 对称性 。分别采用密度泛
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( ) ( )
函理论 DFT 和 MP2 方法 ,在 6 - 311 + + G 3 d , 3 p 水平 ,对结构 A 的结构和结合能进行了比较计算 ,得
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到结合能 EDFT为 - 41. 88 kJ/ mol , EMP2 为 - 40. 34 kJ/ mol 。
( )
关键词 :分子间相互作用 ; 甘氨酸 …H O ; 结合能 ; 密度泛函 DFT ; MP2
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中图分类号 : O561. 4 文献标识码 :A
1 引言 基酸往往是氨基酸研究的起点 。甘氨酸在极性溶
液和晶体中以两性离子形式存在[5 ] ,而在气态中
氨基酸在极性溶液和晶体中以两性离子形式 以中性分子形式存在[6 ] , 高级 电子相关方法的从
存在[1～4 ] ,并通过氢键与其周围的介质
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